RNA–Protein interactions for RNA: YPL079W

RPL21B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L21B, yeast

Gene RPL21B, Length 483 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL21B	YPL079W	HOP1	P20050	605 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	PTP1	P25044	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YMC1	P32331	307 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	MRPL16	P38064	232 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	SHE1	P38200	338 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	MDM31	P38880	579 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	ALP1	P38971	573 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	BOL3	P39724	118 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	MKC7	P53379	596 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YSA1	Q01976	231 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	VID22	Q05934	901 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	FDH1	Q08911	376 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	RAS1	P01119	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YCL002C	P25565	263 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	HIR2	P32480	875 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	KAP122	P32767	1081 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	TOD6	P34219	525 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	OAR1	P35731	278 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	MCM7	P38132	845 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YHR035W	P38769	630 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	FCY21	P40039	528 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	DDI1	P40087	428 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	LTP1	P40347	161 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YIL152W	P40455	235 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	CFD1	P40558	293 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	CHA4	P43634	648 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	RIM21	P48565	533 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	EXG2	P52911	562 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	BUD9	P53226	547 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	BUD17	P53727	317 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	PGA1	P53896	198 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	CIK1	Q01649	594 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	FDC1	Q03034	503 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	IRC13	Q08630	104 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	UIP4	Q08926	304 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	NPC2	Q12408	173 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	LAG2	Q92325	660 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	KIN28	P06242	306 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	BAR1	P12630	587 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	SNF5	P18480	905 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	APN1	P22936	367 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	STP22	P25604	385 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	ORC2	P32833	620 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	RPS27B	P38711	82 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	FMO1	P38866	432 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	NVJ1	P38881	321 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	NTA1	P40354	457 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	FMC1	P40491	155 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	POP1	P41812	875 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	PPT1	P53043	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	GIC2	Q06648	383 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	CYK3	Q07533	885 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YOL036W	Q08206	761 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	TPO4	Q12256	659 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	HFA1	P32874	2273 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	GPI12	P23797	304 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YCR006C	P25350	157 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	HCM1	P25364	564 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	SSH4	P32343	579 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	SPT14	P32363	452 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YEF1	P32622	495 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	RCN1	P36054	211 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	UTH1	P36135	365 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	FMP23	P38231	175 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	STS1	P38637	319 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	CHL4	P38907	458 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	SIT1	P39980	628 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	CIN1	P40987	1014 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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