RNA–Protein interactions for RNA: YOR193W

PEX27, Transcript of Peripheral peroxisomal membrane protein, yeast

Gene PEX27, Length 1,131 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX27	YOR193W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	YHR177W	P38867	453 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	YHR182W	P38870	785 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	PFS1	P38872	237 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	SNL1	P40548	159 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	CIN2	P46670	268 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	MSP1	P28737	362 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	PSO2	P30620	661 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	COS9	P36034	407 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	ABM1	P47146	123 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	FSH2	Q05015	223 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	YDL109C	Q12103	647 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	RDS1	P25611	832 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	VAM7	P32912	316 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	BLI1	P35727	113 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	YSW1	P38280	609 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	YFL012W	P43580	148 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	KEG1	P43614	200 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	YNR068C	P53754	272 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	YPL107W	Q02873	248 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	GAS2	Q06135	555 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	FSH3	Q99369	266 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX27	YOR193W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	HMX1	P32339	317 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	ECT1	P33412	323 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	MCT1	Q12283	360 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	FRE6	Q12473	712 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	CMK2	P22517	447 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	RBG1	P39729	369 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	VAC7	P53950	1165 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	YLR177W	Q06251	628 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	YLH47	Q06493	454 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	GAT3	Q07928	141 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	YOL075C	Q08234	1294 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	GLE1	Q12315	538 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	MAS1	P10507	462 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	UNG1	P12887	359 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	WSC4	P38739	605 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	RNH201	P53942	307 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	SLT2	Q00772	484 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	ATP16	Q12165	160 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	UBA3	Q99344	299 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	DAP2	P18962	818 aa		2.62	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	SWI3	P32591	825 aa		2.62	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	ANP1	P32629	500 aa		2.62	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	PRY2	P36110	329 aa		2.62	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	YBR241C	P38142	488 aa		2.62	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	AIM23	P47015	356 aa		2.62	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	LST7	P53237	242 aa		2.62	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	YPR078C	Q06813	372 aa		2.62	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	GRR1	P24814	1151 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	TOA1	P32773	286 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	APE4	P38821	490 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	YJR030C	P47101	745 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	AIM33	Q04516	312 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	YDR115W	Q04598	105 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	CKI1	P20485	582 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	EPT1	P22140	391 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	ECM34	P38728	170 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	YHR122W	P38829	231 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	YER184C	P39961	794 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	YMR134W	P40207	237 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	YNL320W	P42840	284 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	YHC3	P47040	408 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	YGR015C	P53208	328 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEX27	YOR193W	PRM1	P53835	661 aa		2.6	□□□□□ -1.99

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