RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	RMD5	Q12508	421 aa		4.12	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.12	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	HTB2	P02294	131 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	COX4	P04037	155 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	RHO2	P06781	192 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	REV1	P12689	985 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
KTR2	YKR061W	CSE1	P33307	960 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	DRE2	P36152	348 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	DTR1	P38125	572 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	DUG2	P38149	878 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	ICS2	P38284	255 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YBR259W	P38338	688 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	SIC1	P38634	284 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	ECM1	P39715	212 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	PAC11	P40960	533 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	PFA3	P42836	336 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	PTR3	P43606	678 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YGL204C	P53089	101 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	IMO32	P53219	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	SUN4	P53616	420 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	CDC123	Q05791	360 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	POS5	Q06892	414 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	ESA1	Q08649	445 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	RGS2	Q99188	309 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	RIF1	P29539	1916 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	TUP1	P16649	713 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
KTR2	YKR061W	YSC83	P32792	385 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	SKT5	P34226	696 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	BMT2	P38278	337 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	VHC1	P38329	1120 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	MIC12	P38341	106 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	BIG1	P38813	335 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	CHS7	P38843	316 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	FET3	P38993	636 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	COX15	P40086	486 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YNL195C	P40168	261 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	POG1	P40473	351 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	OPT1	P40897	799 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YJL163C	P46996	555 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	APS3	P47064	194 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YGL117W	P53133	265 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	VPS60	Q03390	229 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	USA1	Q03714	838 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	ASM4	Q05166	528 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	COQ11	Q05892	277 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YFT2	Q06676	274 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	AAD15	Q08361	143 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	MUM3	Q08750	479 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	RSA1	Q08932	381 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	SIA1	Q12212	622 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	HIS5	P07172	385 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	ABF1	P14164	731 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	GLN3	P18494	730 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	PTC6	P25646	442 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	APL1	P27351	700 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	NAM9	P27929	486 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	PDR3	P33200	976 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	HMT1	P38074	348 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	MRX3	P38172	270 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	HIS2	P38635	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YHL026C	P38740	315 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	SRP14	P38985	146 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	SEO1	P39709	593 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YER184C	P39961	794 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	ERG28	P40030	148 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YDL186W	P48568	277 aa		4.09	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.5 ms