RNA–Protein interactions for RNA: YJL054W

TIM54, Transcript of Component of the mitochondrial TIM22 complex, yeast

Gene TIM54, Length 1,437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIM54	YJL054W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	BIT61	P47041	543 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	PAC10	P48363	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	PHO23	P50947	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	DCR2	Q05924	578 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	BSC1	Q12140	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	COX17	Q12287	69 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	YRM1	Q12340	786 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	SNF8	Q12483	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	PSF1	Q12488	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	SKS1	Q12505	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	YPT6	Q99260	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	BAR1	P12630	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	EXO70	P19658	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	ATG15	P25641	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	EMP70	P32802	667 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	YHR177W	P38867	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	RPE1	P46969	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	AAD10	P47182	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	EXG2	P52911	562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	COS7	Q07788	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	ERD1	P16151	362 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	CTR86	P25355	563 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	DMC1	P25453	334 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	LHS1	P36016	881 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	YOR062C	P36025	268 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	MRPL17	P36528	281 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	RIC1	P40395	1056 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	CAF16	P43569	289 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	TRS85	P46944	698 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	NCE101	Q02820	53 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	MMT1	Q03218	510 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	PLM2	Q04383	521 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	SEI1	Q06058	285 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	BAG7	Q12128	409 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	RPN6	Q12377	434 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIM54	YJL054W	ARG81	P05085	880 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	ATS1	P31386	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	KRE6	P32486	720 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	LTV1	P34078	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	TPO5	P36029	618 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	APE4	P38821	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	ANS1	P38832	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	MNN5	P46982	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	PGU1	P47180	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	SWP1	Q02795	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	FMN1	Q03778	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	GIS1	Q03833	894 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	MTR10	Q99189	972 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	CBS1	P14066	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	KSS1	P14681	368 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	CCA1	P21269	546 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	ERG9	P29704	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	HSP150	P32478	413 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	NGG1	P32494	702 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	JEM1	P40358	645 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	IMA5	P40884	581 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	IAH1	P41734	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	KEL2	P50090	882 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	RDR1	Q08904	546 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	STE12	P13574	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YCL042W	P25572	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	PTC6	P25646	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	LOT5	P34234	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	FAA2	P39518	744 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	XBP1	P40489	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	DIA3	P52290	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YML119W	Q03208	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	MIX14	Q04341	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	NAT4	Q04751	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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