RNA–Protein interactions for RNA: YHL030W

ECM29, Transcript of Scaffold protein, yeast

Gene ECM29, Length 5,607 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM29	YHL030W	FLR1	P38124	548 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SHE1	P38200	338 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	APD1	P38281	316 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YHR112C	P38716	378 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MSS4	P38994	779 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	FAU1	P40099	211 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HXT14	P42833	540 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	COX16	P47081	118 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	NUP57	P48837	541 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	IMO32	P53219	342 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HST3	P53687	447 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	DXO1	Q06349	442 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	OPI10	Q08202	246 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PER33	Q12144	273 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ADK2	P26364	225 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SSS1	P35179	80 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	RRN10	P38204	145 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ECM8	P38246	354 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	STP2	P38704	541 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	JHD1	P40034	492 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	NEO1	P40527	1151 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	CIN1	P40987	1014 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PFA3	P42836	336 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ATH1	P48016	1211 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PEX21	P50091	288 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	BSC5	P53755	489 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MRP51	Q02950	344 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	BUR2	Q05949	395 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PUN1	Q06991	263 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	FCY22	Q12119	530 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	REP2	P03872	296 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YKR104W	P0CE69	306 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MGR1	P25573	417 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PEX34	P25584	144 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ACP1	P32463	125 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MRP4	P32902	394 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SLC1	P33333	303 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	DTR1	P38125	572 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YHK8	P38776	514 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YNL034W	P53963	612 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YNL018C	P53976	612 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YML018C	Q03730	393 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SNO4	Q04902	237 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HSP32	Q08992	237 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	TRM8	Q12009	286 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SNF5	P18480	905 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SRB5	P32585	307 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.6	□□□□□ -1.99	not detected
ECM29	YHL030W	EMC3	P36039	253 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ELO3	P40319	345 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YIR035C	P40579	254 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SNN1	P48232	102 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YLR413W	Q06689	675 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	NDE2	Q07500	545 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YEH1	Q07804	573 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ERP4	Q12450	207 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	FLO11	P08640	1367 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	AI3	P03877	415 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PHO80	P20052	293 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SUR1	P33300	382 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SFC1	P33303	322 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MRPL4	P36517	319 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	APQ12	P40532	138 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	GTS1	P40956	396 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ASK10	P48361	1146 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	BUL1	P48524	976 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	NAS6	P50086	228 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YPL068C	Q02749	293 aa		2.6	□□□□□ -1.99

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