RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	RRI1	Q12468	440 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	UTR1	P21373	530 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	CLB2	P24869	491 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SKT5	P34226	696 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	PCL6	P40038	420 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	TRS85	P46944	698 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	PRY1	P47032	299 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	STB4	P50104	949 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SPT20	P50875	604 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	DUG3	P53871	357 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	MMT1	Q03218	510 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	LDS2	Q08218	356 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RSF2	P46974	1380 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	IMA3	P0CW40	589 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	IMA4	P0CW41	589 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	CBF1	P17106	351 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RPO26	P20435	155 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YAL037W	P39728	267 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	GCN5	Q03330	439 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	IMA2	Q08295	589 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	GAL4	P04386	881 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	ERG9	P29704	444 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	MRPL9	P31334	269 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	MYO3	P36006	1272 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	FHL1	P39521	936 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	COA1	P40452	197 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RPC17	P47076	161 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YJR154W	P47181	346 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SLI1	P53304	468 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RIM13	Q03792	727 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YDR387C	Q04162	555 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	NAT4	Q04751	285 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	CDD1	Q06549	142 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	ATG34	Q12292	412 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	POM152	P39685	1337 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SKN1	P33336	771 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	MRPS5	P33759	307 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	CBP4	P37267	147 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SHO1	P40073	367 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	PMT6	P42934	759 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	AGP3	P43548	558 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	BUD32	P53323	261 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RAD34	Q06665	692 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	DAP1	Q12091	152 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SUC2	P00724	532 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	CTR86	P25355	563 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	LIP5	P32875	414 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	MIC12	P38341	106 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	ERG28	P40030	148 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	CDC1	P40986	491 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	VPS74	Q06385	345 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YLR049C	Q12110	428 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YLL056C	Q12177	298 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YLR122C	Q12312	125 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	TY4B-J	P47024	1803 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	TMT1	P32643	299 aa		3.84	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	VAM7	P32912	316 aa		3.84	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	SLM1	P40485	686 aa		3.84	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	NAS6	P50086	228 aa		3.84	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	MIG2	P53035	382 aa		3.84	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	PKP2	P53170	491 aa		3.84	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	MKC7	P53379	596 aa		3.84	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	MTQ1	P53944	314 aa		3.84	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	GPI15	P53961	229 aa		3.84	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	YDR132C	Q03900	495 aa		3.84	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	THI3	Q07471	609 aa		3.84	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	SNF3	P10870	884 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	NUP1	P20676	1076 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	RBK1	P25332	333 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	YPT11	P48559	417 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	OKP1	P53298	406 aa		3.83	□□□□□ -1.8

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