RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-222	ENST00000592408	NOX5	Q96PH1	765 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	CSRNP1	Q96S65	589 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ATP8B3	O60423	1300 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	RASSF10	A6NK89	507 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PJA2	O43164	708 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPIP5K2	O43314	1243 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	GH2	P01242	217 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAGEA1	P43355	309 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	CACNB3	P54284	484 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP14	P54578	494 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRRC41	Q15345	812 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ASIC2	Q16515	512 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	USH1G	Q495M9	461 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCDC181	Q5TID7	509 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM160B2	Q86V87	743 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	NEK9	Q8TD19	979 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ITPKC	Q96DU7	683 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	FUT8	Q9BYC5	575 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	MED4	Q9NPJ6	270 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	JADE2	Q9NQC1	790 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	KCND2	Q9NZV8	630 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	RNF14	Q9UBS8	474 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	SNX12	Q9UMY4	172 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PSME4	Q14997	1843 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM196B	A6NMK8	535 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408		H3BM21	787 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PDXK	O00764	312 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAP2K7	O14733	419 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79	1e-5	■□□□□ 8.6
EFTUD2-222	ENST00000592408	PLA2G6	O60733	806 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	MED24	O75448	989 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	EYA4	O95677	639 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	POLR2M	P0CAP2	368 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	NR2F2	P24468	414 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PAFAH1B1	P43034	410 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ECM1	Q16610	540 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	AOC3	Q16853	763 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	MSL1	Q68DK7	614 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	VPS36	Q86VN1	386 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PNKP	Q96T60	521 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	STK32B	Q9NY57	414 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PNMA2	Q9UL42	364 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLX4	Q8IY92	1834 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ENC1	O14682	589 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	MSH4	O15457	936 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM13A	O94988	1023 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms