RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRO	Q16827	1216 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	GAREM2	Q75VX8	874 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	DCAF4	Q8WV16	495 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10A2	Q9H208	303 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	3.87	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	BLACE	A4D250	179 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	ACOT7	O00154	380 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	3.86	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	PRODH	O43272	600 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	CLSTN1	O94985	981 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	STYK1	Q6J9G0	422 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	GPATCH3	Q96I76	525 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	ASXL2	Q76L83	1435 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	COL6A2	P12110	1019 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	SCNN1G	P51170	649 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNQ1	P51787	676 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR85	P60893	370 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	NSMF	Q6X4W1	530 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6ZRM9	215 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	VRK3	Q8IV63	474 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	TOR3A	Q9H497	397 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	COX11	Q9Y6N1	276 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	ADCY3	O60266	1144 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	SOD2	P04179	222 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	GNAT1	P11488	350 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	MAN2A2	P49641	1150 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	MRE11	P49959	708 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	ANAPC15	P60006	121 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD1	Q719H9	257 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATC1	Q76KD6	591 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	MIEF2	Q96C03	454 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	NBPF4	Q96M43	638 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNJ15	Q99712	375 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	DSE	Q9UL01	958 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AKAP13-223	ENST00000560957	ENPP3	O14638	875 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	CTGF	P29279	349 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	IL13RA1	P78552	427 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	RIN1	Q13671	783 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	STIL	Q15468	1287 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	NFE2L2	Q16236	605 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	GORAB	Q5T7V8	394 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	TICAM2	Q86XR7	235 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	MKL1	Q969V6	931 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PIF1	Q9H611	641 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	IPPK	Q9H8X2	491 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	WNT9A	O14904	365 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	MEOX1	P50221	254 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPA	Q15257	358 aa		3.82	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms