RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560235.1

TTC23-215, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 23, humanhuman

TSL 5

Gene TTC23, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23-215ENST00000560235 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 RASGRP2Q7LDG7 609 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 CERS3Q8IU89 383 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 RELL1Q8IUW5 271 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 LCORLQ8N3X6 602 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 CEP112Q8N8E3 955 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 RUBCNQ92622 972 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 DPF2Q92785 391 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 GBP3Q9H0R5 595 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 ZNF446Q9NWS9 450 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 DENND2AQ9ULE3 1009 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 TAF1LQ8IZX4 1826 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 ATAD5Q96QE3 1844 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 LY75O60449 1722 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 QSER1Q2KHR3 1735 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 A0A087WWV3 80 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 KIF5CO60282 957 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 MCM3P25205 808 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 LMNB2Q03252 620 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 GPS2Q13227 327 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 SBK1Q52WX2 424 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 MUM1L1Q5H9M0 696 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 FDX2Q6P4F2 183 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 TMTC3Q6ZXV5 915 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 MSANTD4Q8NCY6 345 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 CLIC6Q96NY7 704 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 TSPYL1Q9H0U9 437 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 CUEDC2Q9H467 287 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 ARMT1Q9H993 441 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 RAD18Q9NS91 495 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
TTC23-215ENST00000560235 COL4A1P02462 1669 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 A0A1W2PQC6 194 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 FAM221AA4D161 298 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 TMEM232C9JQI7 657 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 ERLIN1O75477 346 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 URI1O94763 535 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 CAMTA2O94983 1202 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 RXRAP19793 462 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 GPTP24298 496 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 KIF5BP33176 963 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 CYP2C19P33261 490 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 GATA4P43694 442 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 PDE4BQ07343 736 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 TROAPQ12815 778 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 KCNB1Q14721 858 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 TTC38Q5R3I4 469 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 FOXR2Q6PJQ5 311 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 IQUBQ8NA54 791 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 FBXO27Q8NI29 283 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-215ENST00000560235 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms