RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557261.1

FOXN3-215, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 4

Gene FOXN3, Length 625 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-215ENST00000557261 DUOX1Q9NRD9 1551 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 PCDHGA12O60330 932 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 SASH1O94885 1247 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 IGHA1P01876 353 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 CKMP06732 381 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 STYK1Q6J9G0 422 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 CASC1Q6TDU7 716 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 SARGQ9BW04 601 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 FOXQ1Q9C009 403 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 CEP350Q5VT06 3117 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 MYH13Q9UKX3 1938 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 EYA2O00167 538 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 MEIS1O00470 390 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 MYBP10242 640 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 ADH5P11766 374 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 LCP1P13796 627 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 HOXC12P31275 282 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 DGKGP49619 791 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 HTRA3P83110 453 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 SCRN1Q12765 414 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 CCDC57Q2TAC2 916 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 CPA6Q8N4T0 437 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 ORAI3Q9BRQ5 295 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 SPON1Q9HCB6 807 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 ECHDC1Q9NTX5 307 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 USP25Q9UHP3 1055 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 MAST2Q6P0Q8 1798 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 DLEC1Q9Y238 1755 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 H0Y8X5 98 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 LILRB5O75023 590 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 SCG5P05408 212 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 EPXP11678 715 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 ALAS2P22557 587 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 CCND1P24385 295 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 CAP2P40123 477 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 DYMQ7RTS9 669 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 PJA1Q8NG27 643 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 FAM89AQ96GI7 184 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXN3-215ENST00000557261 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms