RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555436.1

CBLN3-202, Transcript of cerebellin 3 precursor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CBLN3, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3-202ENST00000555436 C5orf67F2Z3F1 127 aa21.9■■□□□ 1.1
CBLN3-202ENST00000555436 STAG3L1P0CL83 205 aa21.9■■□□□ 1.1
CBLN3-202ENST00000555436 GPM6BQ13491 265 aa21.9■■□□□ 1.1
CBLN3-202ENST00000555436 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
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CBLN3-202ENST00000555436 PTPROQ16827 1216 aa21.9■■□□□ 1.1
CBLN3-202ENST00000555436 XKR3Q5GH77 459 aa21.9■■□□□ 1.1
CBLN3-202ENST00000555436 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.9■■□□□ 1.1
CBLN3-202ENST00000555436 IL27Q8NEV9 243 aa21.9■■□□□ 1.1
CBLN3-202ENST00000555436 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CBLN3-202ENST00000555436 HLA-CQ95604 372 aa21.9■■□□□ 1.1
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CBLN3-202ENST00000555436 CTNNB1P35222 781 aa21.89■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 KRT2P35908 639 aa21.89■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 BMPR1AP36894 532 aa21.89■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa21.89■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 PPP2R5CQ13362 524 aa21.89■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
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CBLN3-202ENST00000555436 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.89■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 VAV3Q9UKW4 847 aa21.89■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 XIRP2A4UGR9 3374 aa21.89■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 TBX3O15119 743 aa21.88■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 MGEA5O60502 916 aa21.88■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 STBD1O95210 358 aa21.88■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
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CBLN3-202ENST00000555436 NR5A1Q13285 461 aa21.88■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 FAM228AQ86W67 206 aa21.88■■□□□ 1.09
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CBLN3-202ENST00000555436 TNFRSF25Q93038 417 aa21.88■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 ADAM2Q99965 735 aa21.88■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 ADAMTS10Q9H324 1103 aa21.88■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 RGS18Q9NS28 235 aa21.88■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.88■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 DENND3A2RUS2 1198 aa21.87■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 EML1O00423 815 aa21.87■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 JAK2O60674 1132 aa21.87■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 BMP1P13497 986 aa21.87■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 PSMC5P62195 406 aa21.87■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.87■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 SLC24A5Q71RS6 500 aa21.87■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 HAS1Q92839 578 aa21.87■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 CEP89Q96ST8 783 aa21.87■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.87■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 FAM205CA6NFA0 338 aa21.86■■□□□ 1.09
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CBLN3-202ENST00000555436 KCNQ1P51787 676 aa21.86■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 ST3GAL1Q11201 340 aa21.86■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 MTERF2Q49AM1 385 aa21.86■■□□□ 1.09
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CBLN3-202ENST00000555436 PLVAPQ9BX97 442 aa21.86■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.86■■□□□ 1.09
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CBLN3-202ENST00000555436 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa21.85■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 TMEM150BA6NC51 233 aa21.85■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.85■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 C9IYK1 514 aa21.85■■□□□ 1.09
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CBLN3-202ENST00000555436 POTEDQ86YR6 584 aa21.85■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.85■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 MARCH6O60337 910 aa21.84■■□□□ 1.09
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CBLN3-202ENST00000555436 CDC42EP1Q00587 391 aa21.84■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 TRIM29Q14134 588 aa21.84■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 DSC3Q14574 896 aa21.84■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 C8orf34Q49A92 452 aa21.84■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.84■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 LMAN2LQ9H0V9 348 aa21.84■■□□□ 1.09
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CBLN3-202ENST00000555436 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 BTBD18B2RXH4 712 aa21.83■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 TNFRSF10AO00220 468 aa21.83■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
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CBLN3-202ENST00000555436 DNM2P50570 870 aa21.83■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 FAM189BP81408 668 aa21.83■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 DRP2Q13474 957 aa21.83■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 SCLT1Q96NL6 688 aa21.83■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.83■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CBLN3-202ENST00000555436 MUC3AQ02505 3323 aa21.83■■□□□ 1.08
CBLN3-202ENST00000555436 GRM6O15303 877 aa21.82■■□□□ 1.08
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