RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	CYTH3	O43739	400 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	POLR2M	P0CAP2	368 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	SMARCA1	P28370	1054 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	15.75	■□□□□ 0.11	6e-6	■■■□□ 15.4
CS-231	ENST00000552222	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	MCTP2	Q6DN12	878 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	MTMR8	Q96EF0	704 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	PCYT2	Q99447	389 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	GINS2	Q9Y248	185 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		15.75	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	ZBTB5	O15062	677 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	STAG3L1	P0CL83	205 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	INSRR	P14616	1297 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	CDC27	P30260	824 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	FUT2	Q10981	343 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	PAK2	Q13177	524 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	NEDD9	Q14511	834 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	MAF1	Q9H063	256 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	NR2E1	Q9Y466	385 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	ZNF292	O60281	2723 aa		15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	15.74	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		15.73	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	15.73	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	15.73	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	CLCN5	P51795	746 aa		15.73	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		15.73	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	RSPH3	Q86UC2	560 aa		15.73	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		15.73	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		15.73	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	15.73	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	FIBP	O43427	364 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	AOC1	P19801	751 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	SIX5	Q8N196	739 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	GLG1	Q92896	1179 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	ADAM2	Q99965	735 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	HINFP	Q9BQA5	517 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	PFKFB2	O60825	505 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	KCNA2	P16389	499 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	CA8	P35219	290 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	UBE3A	Q05086	875 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	STK3	Q13188	491 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	PLCB4	Q15147	1175 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	NTRK3	Q16288	839 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	ME3	Q16798	604 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	TMC7	Q7Z402	723 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	RNF19A	Q9NV58	838 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	FRYL	O94915	3013 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	KAT6A	Q92794	2004 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	EPCAM	P16422	314 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	SCRN1	Q12765	414 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1

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