RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552009.1

GNPTAB-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-209ENST00000552009 KCNA10Q16322 511 aa8.52□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.52□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 RNF111Q6ZNA4 994 aa8.52□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.52□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa8.52□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 LPIN2Q92539 896 aa8.52□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 ERO1AQ96HE7 468 aa8.52□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 BRMS1Q9HCU9 246 aa8.52□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 TMOD2Q9NZR1 351 aa8.52□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 CPA4Q9UI42 421 aa8.52□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 LAMB1P07942 1786 aa8.52□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
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GNPTAB-209ENST00000552009 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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GNPTAB-209ENST00000552009 TIMM10P62072 90 aa8.51□□□□□ -1.05
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GNPTAB-209ENST00000552009 USP40Q9NVE5 1235 aa8.51□□□□□ -1.05
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GNPTAB-209ENST00000552009 UNCXA6NJT0 531 aa8.5□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
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GNPTAB-209ENST00000552009 ATE1O95260 518 aa8.5□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 RGS3P49796 1198 aa8.5□□□□□ -1.05
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GNPTAB-209ENST00000552009 PICALMQ13492 652 aa8.5□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 RASGRF1Q13972 1273 aa8.5□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.5□□□□□ -1.05
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GNPTAB-209ENST00000552009 ERO1BQ86YB8 467 aa8.5□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.5□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.5□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.5□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 GIPC2Q8TF65 315 aa8.5□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF341Q9BYN7 854 aa8.5□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 KCNK12Q9HB15 430 aa8.5□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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GNPTAB-209ENST00000552009 GREM1O60565 184 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 CYP2C8P10632 490 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 CETPP11597 493 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 RARSP54136 660 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 PPIL2Q13356 520 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 SNAPC2Q13487 334 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 MOGSQ13724 837 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC14A2Q15849 920 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF605Q86T29 641 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM151AQ8WW52 585 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 ARMC5Q96C12 935 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 VWCEQ96DN2 955 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF333Q96JL9 665 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 SP110Q9HB58 689 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 CD320Q9NPF0 282 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 ABCF2Q9UG63 623 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 KIF16BQ96L93 1317 aa8.49□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 MYH13Q9UKX3 1938 aa8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 A0A1B0GUL7 405 aa8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 PDHXO00330 501 aa8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 SRGAP3O43295 1099 aa8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 TLR2O60603 784 aa8.48□□□□□ -1.05
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GNPTAB-209ENST00000552009 CIAO1O76071 339 aa8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 UBOX5O94941 541 aa8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 KRT1P04264 644 aa8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 MCM4P33991 863 aa8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 CCNFP41002 786 aa8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF165P49910 485 aa8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 DCAF15Q66K64 600 aa8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF384Q8TF68 577 aa8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 ATRNL1Q5VV63 1379 aa8.48□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 PEX10O60683 326 aa8.47□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 SEMA7AO75326 666 aa8.47□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 TRIM27P14373 513 aa8.47□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 BTDP43251 543 aa8.47□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 PPATQ06203 517 aa8.47□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 APOBRQ0VD83 1088 aa8.47□□□□□ -1.05
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa8.47□□□□□ -1.05
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