RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 PLCB4Q15147 1175 aa27.05■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 PCNX4Q63HM2 1172 aa27.05■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 CCDC149Q6ZUS6 474 aa27.05■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 RNF19AQ9NV58 838 aa27.05■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 POTEMA6NI47 508 aa27.04■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 POTEGQ6S5H5 508 aa27.04■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 C1orf210Q8IVY1 113 aa27.04■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 SLC39A11Q8N1S5 342 aa27.04■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa27.03■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa27.03■■□□□ 1.92
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PRDM4-202ENST00000547188 PPP1R16BQ96T49 567 aa27.03■■□□□ 1.92
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PRDM4-202ENST00000547188 ZSWIM5Q9P217 1185 aa27.03■■□□□ 1.92
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PRDM4-202ENST00000547188 LRRC43Q8N309 656 aa27.02■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 NME8Q8N427 588 aa27.02■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM87AQ8NBN3 555 aa27.02■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 SLC22A17Q8WUG5 538 aa27.02■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 EVI5LQ96CN4 794 aa27.02■■□□□ 1.92
PRDM4-202ENST00000547188 CCER2I3L3R5 266 aa27.01■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF213O14771 459 aa27.01■■□□□ 1.91
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PRDM4-202ENST00000547188 GPR149Q86SP6 731 aa27.01■■□□□ 1.91
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PRDM4-202ENST00000547188 IGSF9Q9P2J2 1179 aa27.01■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 SIT1Q9Y3P8 196 aa27.01■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 FAM208BQ5VWN6 2430 aa27.01■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 MIA3Q5JRA6 1907 aa27■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 PIBF1Q8WXW3 757 aa27■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 SPDYE4A6NLX3 237 aa26.99■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 GPR182O15218 404 aa26.99■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
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PRDM4-202ENST00000547188 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.99■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 FAM228AQ86W67 206 aa26.99■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 ABI1Q8IZP0 508 aa26.99■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 VPS52Q8N1B4 723 aa26.99■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa26.99■■□□□ 1.91
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PRDM4-202ENST00000547188 RIOX1Q9H6W3 641 aa26.98■■□□□ 1.91
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PRDM4-202ENST00000547188 ODR4Q5SWX8 454 aa26.97■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 RNF169Q8NCN4 708 aa26.97■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 GPR152Q8TDT2 470 aa26.97■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 OSMRQ99650 979 aa26.97■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.97■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 RTKNQ9BST9 563 aa26.97■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 SFXN1Q9H9B4 322 aa26.97■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa26.96■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 HOXA2O43364 376 aa26.96■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGAP8P85298 464 aa26.96■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 CLLU1OSQ5K130 101 aa26.96■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa26.96■■□□□ 1.91
PRDM4-202ENST00000547188 SLC44A3Q8N4M1 653 aa26.96■■□□□ 1.91
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PRDM4-202ENST00000547188 BCAR1P56945 870 aa26.95■■□□□ 1.9
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PRDM4-202ENST00000547188 KIZQ2M2Z5 673 aa26.95■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa26.95■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
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PRDM4-202ENST00000547188 TMEM169Q96HH4 297 aa26.95■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 CDHR1Q96JP9 859 aa26.95■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 USP18Q9UMW8 372 aa26.95■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.94■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 PATJQ8NI35 1801 aa26.94■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 MEIS2O14770 477 aa26.93■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 SRFP11831 508 aa26.93■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 MTMR1Q13613 665 aa26.93■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 HELQQ8TDG4 1101 aa26.93■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 CUL5Q93034 780 aa26.93■■□□□ 1.9
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