RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542019.1

TM7SF3-210, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-210ENST00000542019 SUGCTQ9HAC7 445 aa27.89■■■□□ 2.06
TM7SF3-210ENST00000542019 PCDHA12Q9UN75 941 aa27.89■■■□□ 2.06
TM7SF3-210ENST00000542019 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
TM7SF3-210ENST00000542019 SQORQ9Y6N5 450 aa27.89■■■□□ 2.06
TM7SF3-210ENST00000542019 EPOPA6NHQ4 379 aa27.88■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 UPP2O95045 317 aa27.88■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 NPEPPSP55786 919 aa27.88■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa27.88■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 ADGRE1Q14246 886 aa27.88■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 RAD9AQ99638 391 aa27.88■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 TMX1Q9H3N1 280 aa27.88■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 AKT3Q9Y243 479 aa27.88■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 EYSQ5T1H1 3165 aa27.88■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 POTEMA6NI47 508 aa27.87■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 RFXAPO00287 272 aa27.87■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 ENPP3O14638 875 aa27.87■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 ZBTB39O15060 712 aa27.87■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 PAK2Q13177 524 aa27.87■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 TTC38Q5R3I4 469 aa27.87■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 USP38Q8NB14 1042 aa27.87■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 ADAMTS10Q9H324 1103 aa27.86■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 ERVK-5Q9HDB9 667 aa27.86■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa27.85■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 SLITRK3O94933 977 aa27.85■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 C4orf19Q8IY42 314 aa27.85■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 MAP7D2Q96T17 732 aa27.85■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 CYP26B1Q9NR63 512 aa27.85■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 MGEA5O60502 916 aa27.84■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 RPS6KA5O75582 802 aa27.84■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 TMOD1P28289 359 aa27.84■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 GPC3P51654 580 aa27.84■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 FAM228AQ86W67 206 aa27.84■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 TPH2Q8IWU9 490 aa27.84■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 ARNTL2Q8WYA1 636 aa27.84■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 HSD17B14Q9BPX1 270 aa27.84■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 SMC3Q9UQE7 1217 aa27.84■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 LINC01553A4QN01 128 aa27.83■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 MAFO75444 373 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 OR52Z1P0C646 297 aa27.83■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 YWHABP31946 246 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 CUL4AQ13619 759 aa27.83■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa27.83■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa27.83■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 KIF3AQ9Y496 699 aa27.83■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 INSL6Q9Y581 213 aa27.83■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa27.83■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 COL4A6Q14031 1691 aa27.83■■■□□ 2.05
TM7SF3-210ENST00000542019 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 MCTP1Q6DN14 999 aa27.82■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 C4orf32Q8N8J7 132 aa27.82■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 CEP170P1Q96L14 293 aa27.82■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 MTUS1Q9ULD2 1270 aa27.82■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 ARID2Q68CP9 1835 aa27.82■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 A0A087WWV3 80 aa27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 TECP42680 631 aa27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 TRAPPC10P48553 1259 aa27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 YME1L1Q96TA2 773 aa27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 FTHL17Q9BXU8 183 aa27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 KSR1Q8IVT5 923 aa27.8■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 CRIPAKQ8N1N5 446 aa27.8■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa27.79■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 FGFR4P22455 802 aa27.79■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 IGFBP4P22692 258 aa27.79■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 XKR9Q5GH70 373 aa27.79■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 C17orf80Q9BSJ5 609 aa27.79■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 TTC3P53804 2025 aa27.79■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 H3BQV1 296 aa27.78■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 GPR182O15218 404 aa27.78■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 MED24O75448 989 aa27.78■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 LYPLA2O95372 231 aa27.78■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 NEK9Q8TD19 979 aa27.78■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 NLRP7Q8WX94 980 aa27.78■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 TMEM143Q96AN5 459 aa27.78■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 ADAM2Q99965 735 aa27.78■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 A0A087WZ62 844 aa27.77■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 DARSP14868 501 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms