RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNT2Q6UVM3 1135 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRP10Q7Z4F1 713 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR149Q86SP6 731 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 CABP7Q86V35 215 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAXDQ8IW45 347 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 MB21D1Q8N884 522 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPATA5Q8NB90 893 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF248Q8NDW4 579 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 PIGOQ8TEQ8 1089 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SEPT8Q92599 483 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 STAMQ92783 540 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 MIB2Q96AX9 1013 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 KAZALD1Q96I82 304 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRIMPOLQ96LW4 560 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 FBXO28Q9NVF7 368 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADAMTS8Q9UP79 889 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 TGP01266 2768 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTPRSQ13332 1948 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYO10Q9HD67 2058 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATAD5Q96QE3 1844 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 EMSYQ7Z589 1322 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAD50Q92878 1312 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 TENM1Q9UKZ4 2725 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYO7AQ13402 2215 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 HYDINQ4G0P3 5121 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 CACNA1DQ01668 2161 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 DCLK1O15075 740 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 KLK10O43240 276 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 GRID2O43424 1007 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 BRINP1O60477 761 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 FGF18O76093 207 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 DDX58O95786 925 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRKCGP05129 697 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 LDHBP07195 334 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL17P18621 184 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 VCAM1P19320 739 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 NR1D1P20393 614 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNLYP22749 145 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 CA8P35219 290 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP5P45974 858 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD97P48960 835 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 CPT1AP50416 773 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 INHBCP55103 352 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 RBL2Q08999 1139 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 NEXNQ0ZGT2 675 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 DIXDC1Q155Q3 683 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 TBC1D25Q3MII6 688 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC157Q569K6 752 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 BEND3Q5T5X7 828 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF618Q5T7W0 954 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 GLRX5Q86SX6 157 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDH24Q86UP0 819 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 THNSL1Q8IYQ7 743 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM133AQ8N9E0 248 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2I1PQ8NGU4 316 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR66Q8TBY9 1149 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 PIGKQ92643 395 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTAGE1Q96RT6 745 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SEMA3CQ99985 751 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 IDI2Q9BXS1 227 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP26Q9BXU7 913 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A18Q9H1K4 315 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 RUBCNLQ9H714 662 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SFXN1Q9H9B4 322 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 FSCN3Q9NQT6 498 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 HEBP1Q9NRV9 189 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 GINM1Q9NU53 330 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR70Q9NW82 654 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 C2orf42Q9NWW7 574 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 HYPKQ9NX55 129 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM260Q9NX78 707 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHPF2Q9P2E5 772 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 GABBR1Q9UBS5 961 aa2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms