RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RTP1P59025 263 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UGCGQ16739 394 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FKBP15Q5T1M5 1219 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MFSD14CQ5VZR4 134 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TTI2Q6NXR4 508 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPC24Q8NBT2 197 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPTC7Q8NI37 304 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF507Q8TCN5 953 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ACCSQ96QU6 501 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GPR20Q99678 358 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AP5M1Q9H0R1 490 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ERAP1Q9NZ08 941 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NRBP1Q9UHY1 535 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EMSYQ7Z589 1322 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LRRC10BA6NIK2 292 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC169A6NNP5 214 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 K7ENM7 598 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZBTB39O15060 712 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HBP1O60381 514 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPFIA4O75335 1185 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LGR5O75473 907 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATP1A3P13637 1013 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MSNP26038 577 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TNFAIP2Q03169 654 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPP2R3AQ06190 1150 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LRRC41Q15345 812 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BMT2Q1RMZ1 405 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MTERF2Q49AM1 385 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DUSP28Q4G0W2 176 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC40Q4G0X9 1142 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANO5Q75V66 913 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAEAQ7L5Y9 396 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF720Q7Z2F6 126 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPFIBP1Q86W92 1011 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NELFCDQ8IXH7 590 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RETREG2Q8NC44 543 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR6J1Q8NGC5 347 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HPS3Q969F9 1004 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IQCDQ96DY2 449 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRPC6Q9Y210 931 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 WDR81Q562E7 1941 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DOCK5Q9H7D0 1870 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MCM3APO60318 1980 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRIM49BA6NDI0 452 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SFI1A8K8P3 1242 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RSPH10B2B2RC85 870 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RSPH10BP0C881 870 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CYP2B6P20813 491 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PSMC4P43686 418 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NPEPPSP55786 919 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADAM9Q13443 819 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRIM14Q14142 442 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DGKDQ16760 1214 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLA2G4FQ68DD2 849 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TAPT1Q6NXT6 567 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMC6Q7Z403 805 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC150Q8NCX0 1101 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATP8B4Q8TF62 1192 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SCFD1Q8WVM8 642 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPIRE2Q8WWL2 714 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GBP3Q9H0R5 595 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SEMA6BQ9H3T3 888 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPC25Q9HBM1 224 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KMT5AQ9NQR1 393 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM184BQ9ULE4 1060 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LRRC37A2A6NM11 1700 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A1B0GTH6 734 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF862O60290 1169 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GNRH1P01148 92 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EPB41P11171 864 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CPT1AP50416 773 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COPB1P53618 953 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PEX3P56589 373 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SP3Q02447 781 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STRN3Q13033 797 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MYBPC2Q14324 1141 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EMC2Q15006 297 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRT31Q15323 416 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC144BQ3MJ40 725 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF484Q5JVG2 852 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NPLOC4Q8TAT6 608 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms