RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM86C2PA6NEL3 165 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 CPLX1O14810 134 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 GAS7O60861 476 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 VTNP04004 478 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 SFNP31947 248 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAM15Q13444 863 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 NTRK3Q16288 839 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 RUFY3Q7L099 469 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 RIT2Q99578 217 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 CD207Q9UJ71 328 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 BRWD1Q9NSI6 2320 aa21.77■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 BDP1A6H8Y1 2624 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 XIRP2A4UGR9 3374 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAMTS3O15072 1205 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 MGEA5O60502 916 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 GATMP50440 423 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 TEKT3Q9BXF9 490 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 PRR33A8MZF0 331 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 C9IYK1 514 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 HOXA2O43364 376 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 MBTPS2O43462 519 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 DCXO43602 365 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR32O75388 356 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 JAK3P52333 1124 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 EVCP57679 992 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 UBE3AQ05086 875 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 ZP2Q05996 745 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 CAMK1Q14012 370 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM228AQ86W67 206 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 SCLT1Q96NL6 688 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 MUC3AQ02505 3323 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 MSH4O15457 936 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 CHMP2AO43633 222 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 OATP04181 439 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAJB1P25685 340 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 CLCN3P51790 818 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
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SH3BP2-220ENST00000511663 EFHBQ8N7U6 833 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 TLE6Q9H808 572 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 C11orf16Q9NQ32 467 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
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SH3BP2-220ENST00000511663 NRIP1P48552 1158 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM189BP81408 668 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 TBCKQ8TEA7 893 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
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SH3BP2-220ENST00000511663 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 EVPLQ92817 2033 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 FSD2A1L4K1 749 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 C19orf67A6NJJ6 358 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 TBX10O75333 385 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 DEXIO95424 95 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 LAG3P18627 525 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 IRS1P35568 1242 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 CDC42EP1Q00587 391 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 PRKCEQ02156 737 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 RDM1Q8NG50 284 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC5A5Q92911 643 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 LENG9Q96B70 501 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 TLR9Q9NR96 1032 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 FGF18O76093 207 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 FGFR1P11362 822 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 DNM2P50570 870 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 Q4G0T1 1027 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 GALNT17Q6IS24 598 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 BLIDQ8IZY5 108 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 NLRP7Q8WX94 980 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 MYO7AQ13402 2215 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-220ENST00000511663 KRT17Q04695 432 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
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