RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505553.5

TRAPPC13-208, Transcript of trafficking protein particle complex 13, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC13, Length 1,410 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	HTRA3	P83110	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CEP68	Q76N32	757 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	MIER2	Q8N344	545 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	RNF38	Q9H0F5	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	APAF1	O14727	1248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	AP1G1	O43747	822 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	KDM1A	O60341	852 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	FKTN	O75072	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	DGKI	O75912	1065 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	AMY2A	P04746	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	AMY2B	P19961	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	GALK1	P51570	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	EPHB3	P54753	998 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	GJA9	P57773	515 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SHISA4	Q96DD7	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ORAI2	Q96SN7	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	KRIT1	O00522	736 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	DVL2	O14641	736 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	MATN3	O15232	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	NRDC	O43847	1150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	KCNC1	P48547	511 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	FAM129C	Q86XR2	697 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	NME9	Q86XW9	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553		Q8N1Y9	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	JADE3	Q92613	823 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	GJA10	Q969M2	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRAPPC13-208	ENST00000505553	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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