RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRT2	P35908	639 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD97	P48960	835 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	POLA2	Q14181	598 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	USP38	Q8NB14	1042 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSRNP2	Q9H175	543 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	CYP27B1	O15528	508 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	ENTPD5	O75356	428 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	MSL3P1	P0C860	447 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	PGM1	P36871	562 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	DR1	Q01658	176 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF394	Q53GI3	561 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINS1	Q8NG48	757 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	CALML6	Q8TD86	181 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	PGM2	Q96G03	612 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	PAGE5	Q96GU1	130 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	PNMA3	Q9UL41	463 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRIM17	Q9Y577	477 aa		8.78	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM120B	A0PK00	339 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAS8	O95995	478 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	FLT3	P36888	993 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	SULT2A1	Q06520	285 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	AP1B1	Q10567	949 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPARCL1	Q14515	664 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADRM1	Q16186	407 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	ASIC2	Q16515	512 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM13C	Q8NE31	585 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	GIPC3	Q8TF64	312 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	PHKB	Q93100	1093 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	SELENON	Q9NZV5	590 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	MARCH6	O60337	910 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	SHBG	P04278	402 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUP107	P57740	925 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	RGL2	O15211	777 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	TUB	P50607	506 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	STAT2	P52630	851 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	RTP1	P59025	263 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	ASIC1	P78348	528 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM237	Q96Q45	408 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	SENP2	Q9HC62	589 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRGBP	Q9NV56	204 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	AMACR	Q9UHK6	382 aa		8.77	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0J9YVX5	310 aa		8.76	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM221	A6NGB7	291 aa		8.76	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		8.76	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	CTDNEP1	O95476	244 aa		8.76	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	RSPH10B	P0C881	870 aa		8.76	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	8.76	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	RXRA	P19793	462 aa		8.76	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	8.76	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	HAL	P42357	657 aa		8.76	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	RASGRF1	Q13972	1273 aa		8.76	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	RTN1	Q16799	776 aa		8.76	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	C6orf183	Q5T699	404 aa		8.76	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF43	Q68DV7	783 aa		8.76	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	8.76	□□□□□ -1.01
CRNKL1-205	ENST00000496549	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	8.76	□□□□□ -1.01

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