RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 ETV4P43268 484 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 BCAR1P56945 870 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 CD83Q01151 205 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 SURF1Q15526 300 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 DDB1Q16531 1140 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 LILRA6Q6PI73 481 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 TEPSINQ96N21 525 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 KATNBL1Q9H079 304 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 A0A0G2JNJ9 132 aa6.22□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 NEMP1O14524 444 aa6.22□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 RAB11FIP3O75154 756 aa6.22□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 HMGCRP04035 888 aa6.22□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 NFKB2Q00653 900 aa6.22□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 MOGSQ13724 837 aa6.22□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.22□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.22□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.22□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.22□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 SLC5A5Q92911 643 aa6.22□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 MBD6Q96DN6 1003 aa6.22□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 Q9UFV3 132 aa6.22□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 HOXA5P20719 270 aa6.21□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 CSF2RBP32927 897 aa6.21□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 RGS3P49796 1198 aa6.21□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 ADCY2Q08462 1091 aa6.21□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 TERF2Q15554 542 aa6.21□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.21□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.21□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.21□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.21□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.21□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.21□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.21□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 MCM8Q9UJA3 840 aa6.21□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 APOL3O95236 402 aa6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 MEOX1P50221 254 aa6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 KCNQ1P51787 676 aa6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 SESN3P58005 492 aa6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 UBXN11Q5T124 520 aa6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 BROXQ5VW32 411 aa6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 FERMT2Q96AC1 680 aa6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 MYL10Q9BUA6 226 aa6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 POFUT1Q9H488 388 aa6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 MSRAQ9UJ68 235 aa6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 B8ZZF3 427 aa6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 CNR2P34972 360 aa6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 FAPQ12884 760 aa6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 STAT4Q14765 748 aa6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 MYBPC3Q14896 1274 aa6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 NFIXQ14938 502 aa6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 DGKDQ16760 1214 aa6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 RASSF3Q86WH2 238 aa6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 ATL2Q8NHH9 583 aa6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 INVSQ9Y283 1065 aa6.19□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 KDM1AO60341 852 aa6.18□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 B4GALT3O60512 393 aa6.18□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 ID4P47928 161 aa6.18□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 CTSWP56202 376 aa6.18□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.18□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.18□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.18□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.18□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.18□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.18□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.18□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 VWA7Q9Y334 891 aa6.18□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.18□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 ADAMTS20P59510 1910 aa6.18□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 LAMTOR5O43504 91 aa6.17□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 B4GALT4O60513 344 aa6.17□□□□□ -1.42
PTEN-204ENST00000487939 EYA4O95677 639 aa6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms