RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 CAPS2Q9BXY5 557 aa19.98■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 SEL1LQ9UBV2 794 aa19.98■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 LCMT1Q9UIC8 334 aa19.98■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa19.98■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa19.98■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 RAD51CO43502 376 aa19.98■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 GUCY2FP51841 1108 aa19.98■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 PEX26Q7Z412 305 aa19.98■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 TPCN2Q8NHX9 752 aa19.98■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 WHAMMQ8TF30 809 aa19.98■□□□□ 0.79
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SYNE4-204ENST00000465425 TCP10L2B9ZVM9 353 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 ZBTB39O15060 712 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 FAM153BP0C7A2 387 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 NFIL3Q16649 462 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 PTPROQ16827 1216 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 FAM153CQ494X1 144 aa19.97■□□□□ 0.79
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SYNE4-204ENST00000465425 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 SLC5A5Q92911 643 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 BORCS6Q96GS4 357 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 NACC1Q96RE7 527 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 MKNK1Q9BUB5 465 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 FAM153AQ9UHL3 310 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM59LQ9UK28 342 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 INTUQ9ULD6 942 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 POLD1P28340 1107 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 CEP55Q53EZ4 464 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
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SYNE4-204ENST00000465425 ACTRT1Q8TDG2 376 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 ACER1Q8TDN7 264 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF577Q9BSK1 485 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 IKZF4Q9H2S9 585 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 TMX2Q9Y320 296 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 UBE4BO95155 1302 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 FRMPD4Q14CM0 1322 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 EVI5O60447 810 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 CLSTN1O94985 981 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 KRT14P02533 472 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 HSPA1LP34931 641 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 FMO5P49326 533 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 ODR4Q5SWX8 454 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 CHURC1Q8WUH1 139 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 ARL8AQ96BM9 186 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 WDR11Q9BZH6 1224 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP19.96■□□□□ 0.795e-7■□□□□ 11.3
SYNE4-204ENST00000465425 MUTP22033 750 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 CYP2J2P51589 502 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 IRAK1P51617 712 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 SKIDA1Q1XH10 827 aa19.96■□□□□ 0.79
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SYNE4-204ENST00000465425 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF720Q7Z2F6 126 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 KSR1Q8IVT5 923 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 C10orf67Q8IYJ2 551 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 MREGQ8N565 214 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 KCND2Q9NZV8 630 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 ODF2LQ9ULJ1 636 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 APBA3O96018 575 aa19.95■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 SOX5P35711 763 aa19.95■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 COG2Q14746 738 aa19.95■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa19.95■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 CNKSR1Q969H4 720 aa19.95■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.787e-6■□□□□ 9.4
SYNE4-204ENST00000465425 STK33Q9BYT3 514 aa19.95■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 F8VZ95 297 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 PLSCR1O15162 318 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 LMNB1P20700 586 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 SETQ01105 290 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 FMNL3Q8IVF7 1028 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 IQCKQ8N0W5 287 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 METTL13Q8N6R0 699 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 DNAJC12Q9UKB3 198 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 NENFQ9UMX5 172 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 PPIP5K2O43314 1243 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC172P0C7W6 258 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 CHRNA5P30532 468 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF131P52739 623 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 GNGT1P63211 74 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 SYCP3Q8IZU3 236 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 SCFD2Q8WU76 684 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 TEKT3Q9BXF9 490 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 AP1M1Q9BXS5 423 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 RASSF4Q9H2L5 321 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa19.94■□□□□ 0.78
SYNE4-204ENST00000465425 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
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