RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 TCAF2A6NFQ2 919 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 RFXAPO00287 272 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 LIMS1P48059 325 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR15P49685 360 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 RGS3P49796 1198 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 HTRA3P83110 453 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 NOX5Q96PH1 765 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CROTQ9UKG9 612 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 PRSS38A1L453 326 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 LCHNA4D1U4 455 aa7.43□□□□□ -1.22
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RABGGTB-205ENST00000462042 IL18BPO95998 194 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 MT-CO1P00395 513 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 THBS2P35442 1172 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 IL13RA1P78552 427 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC178Q5BJE1 867 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 KANK2Q63ZY3 851 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC62Q6P9F0 684 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM129CQ86XR2 697 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEFF1Q8IYR6 380 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 STPG3Q8N7X2 389 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 MYPNQ86TC9 1320 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A0A6YYJ9 748 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 KLHL33A6NCF5 533 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 H0Y858 1186 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 PAX4O43316 350 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CUTAO60888 179 aa7.42□□□□□ -1.22
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RABGGTB-205ENST00000462042 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC5A3P53794 718 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.223e-45■■■■■ 92.7
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RABGGTB-205ENST00000462042 CT83Q5H943 113 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 GRAMD4Q6IC98 578 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.42□□□□□ -1.22
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RABGGTB-205ENST00000462042 HOOK2Q96ED9 719 aa7.42□□□□□ -1.22
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RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM240Q5SV17 173 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CDYL2Q8N8U2 506 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 OR14C36Q8NHC7 312 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGGTB-205ENST00000462042 AUTS2Q8WXX7 1259 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
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RABGGTB-205ENST00000462042 HIST1H2AJQ99878 128 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGGTB-205ENST00000462042 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
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RABGGTB-205ENST00000462042 AKAP10O43572 662 aa7.4□□□□□ -1.22
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RABGGTB-205ENST00000462042 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 TSPAN15O95858 294 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 KNG1P01042 644 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 IL13P35225 146 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 RAB27AP51159 221 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CD83Q01151 205 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CLUL1Q15846 466 aa7.4□□□□□ -1.22
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