RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425184.5

RBM39-210, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 526 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-210ENST00000425184 JAZF1Q86VZ6 243 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 NME9Q86XW9 330 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 KIF18BQ86Y91 864 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 NIM1KQ8IY84 436 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 DNERQ8NFT8 737 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 GNRHR2Q96P88 292 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 FEZ1Q99689 392 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 ORAI3Q9BRQ5 295 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 DEF6Q9H4E7 631 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 HMGXB3Q12766 1538 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 ARHGAP6O43182 974 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 KPNA6O60684 536 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 GAS7O60861 476 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 PRLP01236 227 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 CR2P20023 1033 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 MRE11P49959 708 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 NFYCQ13952 458 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 EPHA7Q15375 998 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 TTC38Q5R3I4 469 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 TCTN3Q6NUS6 607 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 USP30Q70CQ3 517 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 TAX1BP1Q86VP1 789 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 C16orf92Q96LL3 132 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 OR10A2Q9H208 303 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 CD248Q9HCU0 757 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 IFT57Q9NWB7 429 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 USP35Q9P2H5 1018 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 OAZ3Q9UMX2 235 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 PLAAQ9Y263 795 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 ZNF623O75123 536 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 INSRRP14616 1297 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 SLC9A1P19634 815 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 RGS3P49796 1198 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 STAT5BP51692 787 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 HS1BP3Q53T59 392 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 CNNM4Q6P4Q7 775 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 MAML3Q96JK9 1138 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 KLC2Q9H0B6 622 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 OXSMQ9NWU1 459 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 FAM184BQ9ULE4 1060 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 MYRFQ9Y2G1 1151 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 TCAF1Q9Y4C2 921 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 SMARCA4P51532 1647 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 FOXS1O43638 330 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 CDC14BO60729 498 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 F2P00734 622 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 SELENOPP49908 381 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 ADCY1Q08828 1119 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 TBR1Q16650 682 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 PPM1KQ8N3J5 372 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 MFSD3Q96ES6 412 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 DPYSL5Q9BPU6 564 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 MSL2Q9HCI7 577 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 TOMM22Q9NS69 142 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 VWA7Q9Y334 891 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-210ENST00000425184 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 PDS5BQ9NTI5 1447 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 MATN2O00339 956 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 DSG1Q02413 1049 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 CREB3L3Q68CJ9 461 aa5.52□□□□□ -1.53
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RBM39-210ENST00000425184 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 GGNQ86UU5 652 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 PASD1Q8IV76 773 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 AHI1Q8N157 1196 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 C7orf31Q8N865 590 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 OR14K1Q8NGZ2 314 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 Q8TCH9 128 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 MTFR1LQ9H019 292 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-210ENST00000425184 SEMA4AQ9H3S1 761 aa5.52□□□□□ -1.53
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