RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412425.1

RAB6C-AS1-201, RAB6C antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB6C-AS1, Length 2,454 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 VTA1Q9NP79 307 aa7.89□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.89□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.89□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 STRNO43815 780 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PAHP00439 452 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IGBP1P78318 339 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LAPTM5Q13571 262 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ITIH4Q14624 930 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 INSCQ1MX18 579 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 EMBQ6PCB8 327 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 VSTM4Q8IW00 320 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NAT14Q8WUY8 206 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NUF2Q9BZD4 464 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 C12orf10Q9HB07 376 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 STAP2Q9UGK3 403 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HMGXB4Q9UGU5 601 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MOSPD1Q9UJG1 213 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 E9PBE3 544 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GJB2P29033 226 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RXRGP48443 463 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RCN2Q14257 317 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 STK11Q15831 433 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GSTA3Q16772 222 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CEP78Q5JTW2 689 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SNX30Q5VWJ9 437 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NEK5Q6P3R8 708 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KLHL35Q6PF15 583 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CROCCP3Q8IVE0 287 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CD302Q8IX05 232 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 BBS5Q8N3I7 341 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 C7orf57Q8NEG2 295 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 STK32AQ8WU08 396 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CDKL2Q92772 493 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KCTD5Q9NXV2 234 aa7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ATP7BP35670 1465 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CCDC169A6NNP5 214 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TMEM114B3SHH9 223 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IDH3BO43837 385 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ADAM23O75077 832 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PAEPP09466 180 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PCNAP12004 261 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ETS2P15036 469 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CTRB1P17538 263 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TXKP42681 527 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HSD17B4P51659 736 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 EPHB4P54760 987 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 UBASH3AP57075 661 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PPP2R2AP63151 447 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 UBXN2AP68543 259 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 C1orf228Q6PIY5 440 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZBED8Q8IZ13 594 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GAB3Q8WWW8 586 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KLHL29Q96CT2 875 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ARHGEF3Q9NR81 526 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PALD1Q9ULE6 856 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RIMKLBQ9ULI2 386 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CFL2Q9Y281 166 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SSH2Q76I76 1423 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 A0A088AWK7 358 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PLSCR1O15162 318 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ATP9AO75110 1047 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TFRCP02786 760 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TPBGLP0DKB5 382 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CDK4P11802 303 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IL32P24001 234 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RGS2P41220 211 aa7.87□□□□□ -1.15
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NCALDP61601 193 aa7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms