RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394744.6

RAB11FIP4-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB11FIP4, Length 1,968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CEP112Q8N8E3 955 aa21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GOLGA1Q92805 767 aa21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TSGA10Q9BZW7 698 aa21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GBP3Q9H0R5 595 aa21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 EPC1Q9H2F5 836 aa21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MACROD2A1Z1Q3 448 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GLTPD2A6NH11 291 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 K7ENM7 598 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PLS1Q14651 629 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 C4orf19Q8IY42 314 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GPRASP2Q96D09 838 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ENC1O14682 589 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SERPING1P05155 500 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PON1P27169 355 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SFNP31947 248 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CHMP4BP1P59074 171 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PSMC5P62195 406 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ACAD9Q9H845 621 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CYP39A1Q9NYL5 469 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MYO6Q9UM54 1294 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 BACH1O14867 736 aa21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CYP2J2P51589 502 aa21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 VGLL4Q14135 290 aa21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NLRX1Q86UT6 975 aa21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MKNK1Q9BUB5 465 aa21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DMAC2Q9NW81 257 aa21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MAGEA1P43355 309 aa21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RGS20O76081 388 aa21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 UCHL3P15374 230 aa21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARID5AQ03989 594 aa21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GBP6Q6ZN66 633 aa21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 AIPL1Q9NZN9 384 aa21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MYPNQ86TC9 1320 aa21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MYH11P35749 1972 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PLS3P13797 630 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CLCN6P51797 869 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ASIC2Q16515 512 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RABGGTAQ92696 567 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ADM5C9JUS6 153 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MAFGO15525 162 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MAPTP10636 758 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NPEPPSP55786 919 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 XKR9Q5GH70 373 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RDM1Q8NG50 284 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GOLGA5Q8TBA6 731 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SIX2Q9NPC8 291 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GCNT4Q9P109 453 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 WDR90Q96KV7 1748 aa21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KCNA2P16389 499 aa21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TREML2Q5T2D2 321 aa21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SCN4AP35499 1836 aa21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PJA2O43164 708 aa21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KLHL30Q0D2K2 578 aa21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms