RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366672.4

GALNT2-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT2, Length 4,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT2-201ENST00000366672 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.02■□□□□ 0.8
GALNT2-201ENST00000366672 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
GALNT2-201ENST00000366672 CD58P19256 250 aa20.02■□□□□ 0.8
GALNT2-201ENST00000366672 RASSF2P50749 326 aa20.02■□□□□ 0.8
GALNT2-201ENST00000366672 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.83e-6■□□□□ 8.1
GALNT2-201ENST00000366672 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
GALNT2-201ENST00000366672 MGARPQ8TDB4 240 aa20.02■□□□□ 0.8
GALNT2-201ENST00000366672 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
GALNT2-201ENST00000366672 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.02■□□□□ 0.8
GALNT2-201ENST00000366672 A6NJR5 290 aa20.02■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.02■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 ZNF302Q9NR11 478 aa20.02■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 TNS2Q63HR2 1409 aa20.01■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 A0A1B0GUA9 196 aa20.01■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.01■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 H7C0C1 242 aa20.01■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 COPB2P35606 906 aa20.01■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 ATP5OP48047 213 aa20.01■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 ARHGEF6Q15052 776 aa20.01■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.01■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 MCUR1Q96AQ8 359 aa20.01■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 SNX25Q9H3E2 840 aa20.01■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.01■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 VAMP7P51809 220 aa20.01■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 SEC23AQ15436 765 aa20.01■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 KCNF1Q9H3M0 494 aa20.01■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 MYOM1P52179 1685 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 C19orf81C9J6K1 198 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 PSMD14O00487 310 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 PTPAQ15257 358 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 C2orf69Q8N8R5 385 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 DAGLBQ8NCG7 672 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 ECEL1O95672 775 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 OTUD5Q96G74 571 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 MAD2L2Q9UI95 211 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 STK4Q13043 487 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 MTMR2Q13614 643 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 ZNF667Q5HYK9 610 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 CCDC13Q8IYE1 715 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 CCT5P48643 541 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 ZNF131P52739 623 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 PLTPP55058 493 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa19.99■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 C7orf31Q8N865 590 aa19.99■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 AGBL3Q8NEM8 1001 aa19.99■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 MTRQ99707 1265 aa19.99■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 CCZ1BP86790 482 aa19.99■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 CAPN7Q9Y6W3 813 aa19.99■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 TTLL4Q14679 1199 aa19.99■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 FAM213AQ9BRX8 229 aa19.99■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 ODF2LQ9ULJ1 636 aa19.99■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 SCINQ9Y6U3 715 aa19.99■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 MYMKA6NI61 221 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 SRGNP10124 158 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 RFX1P22670 979 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 CATSPER4Q7RTX7 472 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 KCTD17Q8N5Z5 321 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 HIP1RO75146 1068 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.797e-7■□□□□ 9.9
GALNT2-201ENST00000366672 RWDD2BP57060 319 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 CUL1Q13616 776 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 KRT39Q6A163 491 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 TIPINQ9BVW5 301 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 PALMO75781 387 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 Q3C1V9 767 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 ZNF280CQ8ND82 737 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 ZDHHC15Q96MV8 337 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 NBPF3Q9H094 633 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 LLGL1Q15334 1064 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 HPS3Q969F9 1004 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 C2orf40Q9H1Z8 148 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 SLC9A2Q9UBY0 812 aa19.98■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 PHKA2P46019 1235 aa19.97■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 GRIN1Q05586 938 aa19.97■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 NTRK3Q16288 839 aa19.97■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 RFX6Q8HWS3 928 aa19.97■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
GALNT2-201ENST00000366672 ERICH1Q86X53 443 aa19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms