RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA8MH3BSY2 632 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 KLC3Q6P597 504 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 PADI6Q6TGC4 694 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 GPC3P51654 580 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 NECTIN1Q15223 517 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 CENPUQ71F23 418 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24■■□□□ 1.43
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PTPRM-201ENST00000332175 TTC25Q96NG3 672 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 FMO2Q99518 471 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
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PTPRM-201ENST00000332175 SCINQ9Y6U3 715 aa24■■□□□ 1.43
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PTPRM-201ENST00000332175 GCKP35557 465 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 OXER1Q8TDS5 423 aa23.99■■□□□ 1.43
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PTPRM-201ENST00000332175 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM270Q6UE05 265 aa23.99■■□□□ 1.43
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PTPRM-201ENST00000332175 CD209Q9NNX6 404 aa23.97■■□□□ 1.43
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PTPRM-201ENST00000332175 POTEBQ6S5H4 581 aa23.97■■□□□ 1.43
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PTPRM-201ENST00000332175 COL15A1P39059 1388 aa23.96■■□□□ 1.43
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PTPRM-201ENST00000332175 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 PDIK1LQ8N165 341 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 OTUD5Q96G74 571 aa23.96■■□□□ 1.43
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PTPRM-201ENST00000332175 MFAP3LO75121 409 aa23.96■■□□□ 1.43
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PTPRM-201ENST00000332175 RNF146Q9NTX7 359 aa23.96■■□□□ 1.43
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PTPRM-201ENST00000332175 TSPY1Q01534 308 aa23.95■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.95■■□□□ 1.43
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRM-201ENST00000332175 KIF1BO60333 1816 aa23.95■■□□□ 1.42
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