RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283206.8

TMEM87B-201, Transcript of transmembrane protein 87B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TMEM87B, Length 5,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87B-201ENST00000283206 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 FDX1P10109 184 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 GNAT1P11488 350 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 TNFAIP2Q03169 654 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 IFT88Q13099 833 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 CDO1Q16878 200 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 TSGA10IPQ3SY00 556 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 SLC4A1P02730 911 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 ELF1P32519 619 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 IQCB1Q15051 598 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 CRB1P82279 1406 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 DENND3A2RUS2 1198 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.011e-8■■■■□ 21.4
TMEM87B-201ENST00000283206 ALS2CLQ60I27 953 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 NUDCD1Q96RS6 583 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 CLTCL1P53675 1640 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 POTEFA5A3E0 1075 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 POTEIP0CG38 1075 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 SLC7A5Q01650 507 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 NNTQ13423 1086 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 CUL1Q13616 776 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 RCN2Q14257 317 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 ARID5BQ14865 1188 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 ZNF568Q3ZCX4 644 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 POTEGQ6S5H5 508 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 POTEEQ6S8J3 1075 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 CENPUQ71F23 418 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 NCAPGQ9BPX3 1015 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 ZWILCHQ9H900 591 aa15□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 LRRC53A6NM62 1247 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 EMBQ6PCB8 327 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 BPIFA3Q9BQP9 254 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 POLD4Q9HCU8 107 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 GLI2P10070 1586 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 TJP3O95049 919 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 AKR1B1P15121 316 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 DMTNQ08495 405 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 Q9H521 79 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 ZBTB7AO95365 584 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 SERPINB6P35237 376 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 USP11P51784 963 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 SESN3P58005 492 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 ZNF699Q32M78 642 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 C12orf60Q5U649 245 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 PODXLO00592 558 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 SLC8A1P32418 973 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 EPHB1P54762 984 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 TMCO4Q5TGY1 634 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 ZNF302Q9NR11 478 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 PALMO75781 387 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 TDP2O95551 362 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 MYL3P08590 195 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 GPC5P78333 572 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 PSMC5P62195 406 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 TFDP2Q14188 446 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 CASP8Q14790 479 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 TMEM270Q6UE05 265 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 KIF3CO14782 793 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 CLCN6P51797 869 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 SEMA3FQ13275 785 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 TTLL4Q14679 1199 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 MTRQ99707 1265 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 ACAD9Q9H845 621 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 TTC36A6NLP5 189 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 TTC4O95801 387 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 CA4P22748 312 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 HSPH1Q92598 858 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 LRGUKQ96M69 825 aa14.98□□□□□ -0.01
TMEM87B-201ENST00000283206 GBP5Q96PP8 586 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms