RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 RNF19AQ9NV58 838 aa18.92■□□□□ 0.62
SPCS1-201ENST00000233025 IGSF9Q9P2J2 1179 aa18.92■□□□□ 0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 STK25O00506 426 aa18.91■□□□□ 0.62
SPCS1-201ENST00000233025 DCNP07585 359 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP8P85298 464 aa18.91■□□□□ 0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 A0A0D9SFI3 127 aa18.9■□□□□ 0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 POTEGQ6S5H5 508 aa18.9■□□□□ 0.62
SPCS1-201ENST00000233025 GPR149Q86SP6 731 aa18.9■□□□□ 0.62
SPCS1-201ENST00000233025 SLC22A17Q8WUG5 538 aa18.9■□□□□ 0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa18.9■□□□□ 0.62
SPCS1-201ENST00000233025 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa18.89■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 KLRF2D3W0D1 207 aa18.89■□□□□ 0.61
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SPCS1-201ENST00000233025 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
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SPCS1-201ENST00000233025 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
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SPCS1-201ENST00000233025 HOMER1Q86YM7 354 aa18.88■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 NME8Q8N427 588 aa18.88■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 ZBP1Q9H171 429 aa18.88■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 SFXN1Q9H9B4 322 aa18.88■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 MAD2L2Q9UI95 211 aa18.88■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 IRAK3Q9Y616 596 aa18.88■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
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SPCS1-201ENST00000233025 TGM1P22735 817 aa18.87■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 DSC3Q14574 896 aa18.87■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa18.87■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 NLRX1Q86UT6 975 aa18.87■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 CABP7Q86V35 215 aa18.87■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 RSAD2Q8WXG1 361 aa18.87■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 GPRASP2Q96D09 838 aa18.87■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 CHAMP1Q96JM3 812 aa18.87■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 GINS2Q9Y248 185 aa18.87■□□□□ 0.61
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SPCS1-201ENST00000233025 CA8P35219 290 aa18.86■□□□□ 0.61
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SPCS1-201ENST00000233025 LETM2Q2VYF4 491 aa18.86■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF528Q3MIS6 628 aa18.86■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 FAM228AQ86W67 206 aa18.86■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 AUTS2Q8WXX7 1259 aa18.86■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 BORCS6Q96GS4 357 aa18.86■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 PIGSQ96S52 555 aa18.86■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 DOCK6Q96HP0 2047 aa18.86■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 SALL3Q9BXA9 1300 aa18.85■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 GPR182O15218 404 aa18.85■□□□□ 0.61
SPCS1-201ENST00000233025 ODR4Q5SWX8 454 aa18.85■□□□□ 0.61
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