RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pou3f3P31361 497 aa17.65■□□□□ 0.42
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hps5P59438 1126 aa17.65■□□□□ 0.42
Casq1-201ENSMUST00000003554 Irf3P70671 419 aa17.65■□□□□ 0.42
Casq1-201ENSMUST00000003554 Etaa1Q5SVT3 877 aa17.65■□□□□ 0.42
Casq1-201ENSMUST00000003554 AlcamQ61490 583 aa17.65■□□□□ 0.42
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mtmr10Q7TPM9 771 aa17.65■□□□□ 0.42
Casq1-201ENSMUST00000003554 Bmp3Q8BHE5 468 aa17.65■□□□□ 0.42
Casq1-201ENSMUST00000003554 Skor2A7M7C7 1008 aa17.64■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tnfrsf11aO35305 625 aa17.64■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Clk2O35491 499 aa17.64■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 RenbpP82343 430 aa17.64■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Capn13Q3UW68 665 aa17.64■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adam39Q7M762 756 aa17.64■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rcor2Q8C796 523 aa17.64■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Spice1Q8C804 860 aa17.64■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Reep2Q8VCD6 254 aa17.64■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sgms1Q8VCQ6 419 aa17.64■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Plcb4Q91UZ1 1175 aa17.64■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Apopt1Q9CQW7 192 aa17.64■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mfap3lQ9D3X9 409 aa17.64■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc12a7Q9WVL3 1083 aa17.64■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam129cD3YZB0 591 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cyth3O08967 399 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fgd3O88842 733 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tp53P02340 387 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prmt6Q6NZB1 378 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dnm3Q8BZ98 863 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 SucoQ8C341 1250 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Stoml1Q8CI66 399 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Usp34Q6ZQ93 3582 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm1993A6X8I0 212 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 SlxD3Z347 212 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 LxnP70202 222 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adamts18Q4VC17 1219 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tpm4Q6IRU2 248 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mindy1Q76LS9 468 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pym1Q8CHP5 203 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccdc14Q8K2J4 934 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Wrap53Q8VC51 532 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Med15Q924H2 789 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Smtnl1Q99LM3 459 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Q9CYI0 393 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olr1Q9EQ09 363 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 PolkQ9QUG2 852 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ercc4Q9QZD4 917 aa17.63■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prpmp5E9PXN1 296 aa17.62■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Znf568E9PYI1 671 aa17.62■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Becn1O88597 448 aa17.62■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gja3Q64448 417 aa17.62■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zbtb5Q7TQG0 670 aa17.62■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mei4Q8BRM6 389 aa17.62■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Map1sQ8C052 973 aa17.62■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 N4bp3Q8C7U1 537 aa17.62■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ppp1r3aQ99MR9 1089 aa17.62■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Eef1gQ9D8N0 437 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Smco2Q9DA21 347 aa17.62■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 PorcnQ9JJJ7 461 aa17.62■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tnfsf13bQ9WU72 309 aa17.62■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vstm4T1NXB5 319 aa17.62■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 NfkbieO54910 364 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Myo1aO88329 1043 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hoxc6P10629 235 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adcy7P51829 1099 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Drp2Q05AA6 957 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 SobpQ0P5V2 864 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ddrgk1Q80WW9 315 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fbxo44Q8BK26 255 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem161bQ8C2L6 487 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ifi35Q9D8C4 286 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Myo5aQ99104 1853 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm21973F6WEZ7 68 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kcnh2O35219 1162 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 RaraP11416 462 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 VegfbP49766 207 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 MafP54843 370 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atp13a4Q5XF90 1193 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cyp3a11Q64459 504 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ctnna3Q65CL1 895 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pdcl2Q78Y63 240 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atp6v0d2Q80SY3 350 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gpr180Q8BPS4 441 aa17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Brd3Q8K2F0 726 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Uso1Q9Z1Z0 959 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ank3G5E8K5 1961 aa17.6■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 AU015836B2RUM3 263 aa17.6■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm4841E9QAA8 417 aa17.6■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tpp1O89023 562 aa17.6■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tpm1P58771 284 aa17.6■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tff2Q03404 129 aa17.6■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 SlmapQ3URD3 845 aa17.6■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Foxn1Q61575 648 aa17.6■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Krt31Q61765 416 aa17.6■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vps52Q8C754 723 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa17.6■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 CenpqQ9CPQ5 267 aa17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.6 ms