RNA–Protein interactions for RNA: tM(CAU)C

tM(CAU)C, Transcript of Methionine tRNA (tRNA-Met), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tM(CAU)C, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tM(CAU)CtM(CAU)C SHO1P40073 367 aa11.07□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C RIM13Q03792 727 aa11.07□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C CLB3P24870 427 aa11.06□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C OXP1P28273 1286 aa11.06□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C MTR2P34232 184 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C TSC10P38342 320 aa11.06□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C YML119WQ03208 357 aa11.06□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C EKI1Q03764 534 aa11.06□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C AIM17P23180 465 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C TEF4P36008 412 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C MGE1P38523 228 aa11.05□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C IMA5P40884 581 aa11.05□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C YNR068CP53754 272 aa11.05□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C RSN1Q03516 953 aa11.05□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C FMN1Q03778 218 aa11.05□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C URC2Q04411 772 aa11.05□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C PSY3Q12318 242 aa11.05□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C CDC36P06100 191 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C TOP3P13099 656 aa11.04□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C REC107P21651 314 aa11.04□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C MDH2P22133 377 aa11.04□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C RPS1BP23248 255 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C RPI1P23250 407 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C YCK1P23291 538 aa11.04□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data11.04□□□□□ -0.64not detected
tM(CAU)CtM(CAU)C MNN9P39107 395 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C TRS85P46944 698 aa11.04□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C COS6P53344 381 aa11.04□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C MTQ1P53944 314 aa11.04□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C MMT1Q03218 510 aa11.04□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C RAD33Q04231 177 aa11.04□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C PDX1P16451 410 aa11.03□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C ERP5P38819 212 aa11.03□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C FAD1P38913 306 aa11.03□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C SEN34P39707 275 aa11.03□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C TOS2P50078 622 aa11.03□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C OGG1P53397 376 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C HNT3Q08702 217 aa11.03□□□□□ -0.64
tM(CAU)CtM(CAU)C ATP6P00854 259 aa11.02□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C HTA1P04911 132 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C TPK2P06245 380 aa11.02□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C STE6P12866 1290 aa11.02□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C YIM1P28625 365 aa11.02□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C EHD3P28817 500 aa11.02□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C IST2P38250 946 aa11.02□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C MTC4P38335 694 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C YGP1P38616 354 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C DIA3P52290 468 aa11.02□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C SOK2P53438 785 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C RSC9Q03124 581 aa11.02□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C HEM4P06174 275 aa11.01□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C MET2P08465 486 aa11.01□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C BIG1P38813 335 aa11.01□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C MTW1P39731 289 aa11.01□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data11.01□□□□□ -0.65not detected
tM(CAU)CtM(CAU)C MSY1P48527 492 aa11.01□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C COX20Q04935 205 aa11.01□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C ARV1Q06541 321 aa11.01□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C NSL1Q12143 216 aa11.01□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data11.01□□□□□ -0.65not detected
tM(CAU)CtM(CAU)C MF(ALPHA)1P01149 165 aa11□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C MOD5P07884 428 aa11□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C HPM1P40481 377 aa11□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C NIT2P47016 307 aa11□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C LYS5P50113 272 aa11□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C YPL039WQ03080 316 aa11□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C MFG1Q07684 458 aa11□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C RDL2Q08742 149 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C MCP1Q12106 302 aa11□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C YOR214CQ12282 236 aa11□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C RIB2Q12362 591 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C RPP1BP10622 106 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C SEC2P17065 759 aa10.99□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C LTV1P34078 463 aa10.99□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C RFC3P38629 340 aa10.99□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C YNL195CP40168 261 aa10.99□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C TWF1P53250 332 aa10.99□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C KRE28Q04431 385 aa10.99□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C THP2O13539 261 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C CAR2P07991 424 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C GAL3P13045 520 aa10.98□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C YMR144WP40214 342 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C DYN3Q04949 312 aa10.98□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C EMG1Q06287 252 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C RAF1Q06891 181 aa10.98□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C BRX1Q08235 291 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C ENB1Q08299 606 aa10.98□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C YPR202WQ08993 238 aa10.98□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C YDL211CQ12121 372 aa10.98□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C SCO1P23833 295 aa10.97□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C CSM1P25651 190 aa10.97□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C DEP1P31385 405 aa10.97□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C MAL32P38158 584 aa10.97□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C YHL037CP38733 133 aa10.97□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C MTC6P38849 526 aa10.97□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C YHR180WP38868 163 aa10.97□□□□□ -0.65
tM(CAU)CtM(CAU)C GAT2P40209 560 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 104.9 ms