RNA–Protein interactions for RNA: YPL212C

PUS1, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS1, Length 1,635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS1	YPL212C	TOD6	P34219	525 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	ZRT3	P34240	503 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	EMC3	P36039	253 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	SER3	P40054	469 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	APQ12	P40532	138 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YKE4	P40544	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	MET28	P40573	187 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	MAD2	P40958	196 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	ATG18	P43601	500 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	IRC7	P43623	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	MDV1	P47025	714 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	HXT16	P47185	567 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	ROG1	P53118	685 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	FLC3	P53121	802 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	MRH4	P53166	561 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	COG7	P53195	279 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	TDA1	Q03533	586 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	VID22	Q05934	901 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RTR2	Q12378	196 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	SFG1	Q12507	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	STE7	P06784	515 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	MET2	P08465	486 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	FUS1	P11710	512 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	SEN2	P16658	377 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	PPQ1	P32945	549 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YBR242W	P38331	238 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	GGC1	P38988	300 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YJL068C	P40363	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	FMC1	P40491	155 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	GDS1	P41913	522 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	CHA4	P43634	648 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	MNN5	P46982	586 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	EXG2	P52911	562 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	COS12	P53053	380 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	MKC7	P53379	596 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	MNT4	P53745	580 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	SNF6	P18888	332 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	HSP30	P25619	332 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YIM1	P28625	365 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	ERG9	P29704	444 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	HYM1	P32464	399 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	MKK1	P32490	508 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	SUR1	P33300	382 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YBR137W	P38276	179 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	VMA7	P39111	118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	PIC2	P40035	300 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	FAU1	P40099	211 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	SNM1	P40993	198 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	SNX4	P47057	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	NBP35	P52920	328 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	MAL11	P53048	616 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	TPN1	P53099	579 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YGR079W	P53249	370 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YNL034W	P53963	612 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	AAT1	Q01802	451 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	AIM36	Q03798	255 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	DCI1	Q08558	271 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RAX1	Q08760	435 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	MDM32	Q12171	622 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	GLO4	Q12320	285 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RKM5	Q12367	367 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RTN2	Q12443	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	REV1	P12689	985 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	KIN3	P22209	435 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	NPR1	P22211	790 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	AHC2	P25649	128 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17 ms