RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	MNN2	P38069	597 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	WSC4	P38739	605 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	MNL1	P38888	796 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	MET30	P39014	640 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	MTW1	P39731	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	GPI8	P49018	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	DAM1	P53267	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	GPI11	Q06636	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	FDH1	Q08911	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	SEC39	Q12745	709 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	COR1	P07256	457 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	MER1	P16523	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	GRR1	P24814	1151 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	ERG4	P25340	473 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	HCS1	P34243	683 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	MRPL15	P36523	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	SCO2	P38072	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	SLM4	P38247	162 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	STP2	P38704	541 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	MTG2	P38860	518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	ECM10	P39987	644 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	AZF1	P41696	914 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	ELP2	P42935	788 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	FAR7	P43592	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	PMT4	P46971	762 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	BIO3	P50277	480 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	SED5	Q01590	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	RRN5	Q02983	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	REH1	Q06709	432 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	TEN1	Q07921	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	RSA1	Q08932	381 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	ATR1	P13090	542 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	HOP1	P20050	605 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RPB5	P20434	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	VPS33	P20795	691 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RIB1	P38066	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YPS6	P40583	537 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YGR201C	P42936	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	IBA57	P47158	497 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	AAD10	P47182	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	BUL1	P48524	976 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	KRE28	Q04431	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	ARR1	Q06596	294 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	LOT6	Q07923	191 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	GLE1	Q12315	538 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RKM5	Q12367	367 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	SKM1	Q12469	655 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	ALG7	P07286	448 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	MET3	P08536	511 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	SNF4	P12904	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	KSS1	P14681	368 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YCL049C	P25577	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	NTG1	P31378	399 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	PUP2	P32379	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	MSN2	P33748	704 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	LOT5	P34234	306 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	LHS1	P36016	881 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	IFA38	P38286	347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	BIG1	P38813	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	TRR2	P38816	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YHR177W	P38867	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	FAU1	P40099	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	LAS21	P40367	830 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	VHR1	P40522	640 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	MET28	P40573	187 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	AGP3	P43548	558 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YGR168C	P53293	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YNL181W	P53878	407 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	ASI2	P53895	289 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RHO4	Q00246	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	TIM44	Q01852	431 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RIM13	Q03792	727 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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