RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	ASK1	P35734	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	BET3	P36149	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	ATM1	P40416	690 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	PAN6	P40459	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	BAP3	P41815	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SPO74	P45819	413 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SNG1	P46950	547 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	UFD1	P53044	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YGR053C	P53234	283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	KIN4	Q01919	800 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	GRC3	Q07845	632 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	GIS3	Q12418	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RIB1	P38066	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
CLF1	YLR117C	SHG1	P38337	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	BIT2	P38346	545 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RAD55	P38953	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	AFG3	P39925	761 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	PRM10	P42946	383 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	TAX4	P47030	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	ROG1	P53118	685 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	GND2	P53319	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	ERV29	P53337	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
CLF1	YLR117C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RIF2	Q06208	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SSK1	Q07084	712 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YOL131W	Q08270	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RAD28	Q12021	506 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	CDC7	P06243	507 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	FBP1	P09201	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	NAM2	P11325	894 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	FUN14	P18411	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SEC62	P21825	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	GID7	P25569	745 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	EMC1	P25574	760 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YCR015C	P25616	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RCK1	P38622	512 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	HSE1	P38753	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	UBA4	P38820	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YEN1	P40028	759 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	ICP55	P40051	511 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	FAU1	P40099	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	NTA1	P40354	457 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	ATG18	P43601	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	TAD2	P47058	250 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	GCV1	P48015	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	PUS2	P53167	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	VOA1	P53262	265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	GAS3	Q03655	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RFU1	Q08003	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	COX6	P00427	148 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
CLF1	YLR117C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	CPR4	P25334	318 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	FRE2	P36033	711 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	POA1	P38218	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	AIM46	P38885	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	PRM9	P39551	298 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	POG1	P40473	351 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	GDS1	P41913	522 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	CHA4	P43634	648 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SIP4	P46954	829 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	NIT2	P47016	307 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RKM2	Q03942	479 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YDR124W	Q04608	324 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	GAD1	Q04792	585 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	CDC123	Q05791	360 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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