RNA–Protein interactions for RNA: YJL054W

TIM54, Transcript of Component of the mitochondrial TIM22 complex, yeastyeast

Gene TIM54, Length 1,437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIM54YJL054W SLF1Q12034 447 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
TIM54YJL054W YKL068W-AQ3E826 78 aa4.97□□□□□ -1.61
TIM54YJL054W SAS5Q99314 248 aa4.97□□□□□ -1.61
TIM54YJL054W DIF1O13577 133 aa4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W RAS2P01120 322 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W AAC3P18238 307 aa4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W DAP2P18962 818 aa4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W RPC19P28000 142 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W VPS51P36116 164 aa4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W GLG1P36143 616 aa4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W SHM2P37291 469 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W AIM2P39721 246 aa4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W SDP1P40479 209 aa4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W RLP7P40693 322 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W EMC2P47133 292 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W BPL1P48445 690 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W CDH1P53197 566 aa4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W BSC5P53755 489 aa4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W ATG4P53867 494 aa4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W YPL068CQ02749 293 aa4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W CGI121Q03705 181 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W NTG2Q08214 380 aa4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W PRS5Q12265 496 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W JLP1Q12358 412 aa4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W MDM12Q92328 271 aa4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W YOS9Q99220 542 aa4.96□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W PHO2P07269 559 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W MEF1P25039 761 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W RVS161P25343 265 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W PHO91P27514 894 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W PTC1P35182 281 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W FES1P38260 290 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W HSM3P38348 480 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W TDA11P38854 504 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W PKP1P40530 394 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W CIN1P40987 1014 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W GAB1P41733 394 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W TDA10P42938 290 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W ECO1P43605 281 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W BNA3P47039 444 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W RPS12P48589 143 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W UBC9P50623 157 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W YLR460CP54007 376 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W UGO1Q03327 502 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W YLL007CQ07799 665 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W SGT1Q08446 395 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W SWM1Q12379 170 aa4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W SSA3P09435 649 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W ERG8P24521 451 aa4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W SEC17P32602 292 aa4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W MRE11P32829 692 aa4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W STP2P38704 541 aa4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data4.94□□□□□ -1.62not detected
TIM54YJL054W MSS4P38994 779 aa4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W PZF1P39933 429 aa4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W PMT4P46971 762 aa4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W SSY5P47002 699 aa4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W YJL043WP47053 257 aa4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W IMA1P53051 589 aa4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W RPN14P53196 417 aa4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W TPC1P53257 314 aa4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W YSA1Q01976 231 aa4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W LGE1Q02796 332 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W YLR446WQ06204 433 aa4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W YKL018C-AQ3E7A7 99 aa4.94□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W RAP1P11938 827 aa4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W UNG1P12887 359 aa4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W YCL049CP25577 312 aa4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W CWH43P25618 953 aa4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W MTC2P34246 357 aa4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data4.93□□□□□ -1.62not detected
TIM54YJL054W CTF8P38877 133 aa4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W VPS41P38959 992 aa4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W LYS12P40495 371 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W HOS2P53096 452 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W YGR079WP53249 370 aa4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W MPA43P53583 542 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W PFA5Q03289 374 aa4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W YHC1Q05900 231 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W FAR10Q06001 478 aa4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W YOL131WQ08270 108 aa4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W NOP58Q12499 511 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W TAD3Q9URQ3 322 aa4.93□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W PHO81P17442 1178 aa4.92□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W MCK1P21965 375 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W PBN1P25580 416 aa4.92□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W MKK1P32490 508 aa4.92□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W NUP2P32499 720 aa4.92□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W SOK1P40317 901 aa4.92□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W YJL068CP40363 299 aa4.92□□□□□ -1.62
TIM54YJL054W VHR1P40522 640 aa4.92□□□□□ -1.62
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