RNA–Protein interactions for RNA: YHL030W

ECM29, Transcript of Scaffold protein, yeast

Gene ECM29, Length 5,607 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM29	YHL030W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	VPS29	P38759	282 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ALP1	P38971	573 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	BAP3	P41815	604 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	AAD14	P42884	376 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	FET5	P43561	622 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	UFD1	P53044	361 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	AIM14	P53109	570 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ORM1	P53224	222 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	GAS3	Q03655	524 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	CAB5	Q03941	241 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	FUS1	P11710	512 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	FPS1	P23900	669 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HCM1	P25364	564 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	OAC1	P32332	324 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MDL1	P33310	695 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MIA40	P36046	403 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YBR225W	P38321	900 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	AXL2	P38928	823 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	IRC22	P40006	225 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	BMT5	P40493	336 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	RIM21	P48565	533 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	COG1	P53079	417 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YGR042W	P53227	271 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	KIN4	Q01919	800 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	VBA1	Q04301	562 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HOF1	Q05080	669 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	CAN1	P04817	590 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HIS3	P06633	220 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	AFG1	P32317	509 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	LOT5	P34234	306 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	FRE2	P36033	711 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	CBP4	P37267	147 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	RIM4	P38741	713 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	GID8	P40208	455 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	DLS1	P40366	167 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	EMC5	P40540	141 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HIS6	P40545	261 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YJL045W	P47052	634 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	GRX5	Q02784	150 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PEX11	Q12462	236 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	DNF3	Q12674	1656 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	GAL3	P13045	520 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	COS9	P36034	407 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SEN34	P39707	275 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	CAF16	P43569	289 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	BIR1	P47134	954 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YMR206W	Q03695	313 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YDL109C	Q12103	647 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	NDJ1	Q12366	352 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YPL247C	Q12523	523 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MDM35	O60200	86 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SIR2	P06700	562 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ALG7	P07286	448 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	TFS1	P14306	219 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	GLN3	P18494	730 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HXT2	P23585	541 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HOG1	P32485	435 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	NDC1	P32500	655 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	CLB6	P32943	380 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MED6	P38782	295 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	BUD32	P53323	261 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	RSM23	Q01163	450 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MFB1	Q04922	465 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	GAS2	Q06135	555 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	FRE5	Q08908	694 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SRL2	Q12020	392 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MED4	Q12343	284 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PCC1	Q3E833	88 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HIS5	P07172	385 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SEC12	P11655	471 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	STE12	P13574	688 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MRPL8	P22353	238 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SNC1	P31109	117 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MSK1	P32048	576 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ASH1	P34233	588 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99

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