RNA–Protein interactions for RNA: YGL137W

SEC27, Transcript of Essential beta'-coat protein of the COPI coatomer, yeast

Gene SEC27, Length 2,670 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEC27	YGL137W	SHO1	P40073	367 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	YNL143C	P53908	130 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	ECM7	Q06200	448 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	VPS74	Q06385	345 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	IES4	Q08561	116 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	LSB5	P25369	354 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	YEL043W	P32618	956 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	SPT8	P38915	602 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	ELP2	P42935	788 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	HMS2	P47175	358 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	RTT102	P53330	157 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	YNR068C	P53754	272 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	YNL146W	P53906	100 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	HXT11	P54862	567 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	COX4	P04037	155 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	INM1	P38710	295 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
SEC27	YGL137W	RPH1	P39956	796 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	RRN9	P53437	365 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	URC2	Q04411	772 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	IPK1	Q06667	281 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	OPI3	P05375	206 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	PHO91	P27514	894 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	COT1	P32798	439 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	PTR2	P32901	601 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	NUP53	Q03790	475 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	CUR1	Q06469	252 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	YFH1	Q07540	174 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	NSE1	Q07913	336 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	EXO70	P19658	623 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	TMT1	P32643	299 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
SEC27	YGL137W	MSG5	P38590	489 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	TVP23	P38962	199 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	FAA2	P39518	744 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	YJL070C	P40361	888 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	ABM1	P47146	123 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	TIM8	P57744	87 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	YDR541C	Q03049	344 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	PIR3	Q03180	325 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	NDD1	Q08887	554 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	REC114	P32841	428 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	PMU1	P36069	295 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	CBP4	P37267	147 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	MNL1	P38888	796 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	SEC9	P40357	651 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	YDL186W	P48568	277 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	RSN1	Q03516	953 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	SMC5	Q08204	1093 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	ATR1	P13090	542 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	TRS65	P32893	560 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	RRF1	P38771	230 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	YDR278C	Q05612	105 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	YLL056C	Q12177	298 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	YBR139W	P38109	508 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	MIX23	P38162	196 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	MRP51	Q02950	344 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	YLR281C	Q05863	155 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	YLR297W	Q05899	129 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SEC27	YGL137W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SEC27	YGL137W	CDC42	P19073	191 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SEC27	YGL137W	SAG1	P20840	650 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SEC27	YGL137W	SMI1	P32566	505 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SEC27	YGL137W	BZZ1	P38822	633 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SEC27	YGL137W	AZR1	P50080	613 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SEC27	YGL137W	MPS1	P54199	764 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SEC27	YGL137W	SHS1	Q07657	551 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SEC27	YGL137W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SEC27	YGL137W	TIM18	Q08749	192 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SEC27	YGL137W	RUP1	Q12242	671 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SEC27	YGL137W	SET6	Q12529	373 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SEC27	YGL137W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SEC27	YGL137W	STE3	P06783	470 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SEC27	YGL137W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SEC27	YGL137W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91

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