RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W YOL075CQ08234 1294 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YLR053CQ12026 108 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W DCS2Q12123 353 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W GET3Q12154 354 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YDR262WQ12331 272 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YOP1Q12402 180 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YOR304C-AO14468 76 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MSF1P08425 469 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W IMA3P0CW40 589 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W IMA4P0CW41 589 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MRP13P12686 339 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PEP5P12868 1029 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MRPL44P19956 98 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PRE7P23724 241 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MGR1P25573 417 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W GPI10P30777 616 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W VMA5P31412 392 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PRP21P32524 280 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PDR3P33200 976 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RPS1AP33442 255 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SIP2P34164 415 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SHP1P34223 423 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RPC25P35718 212 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W DAD2P36162 133 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MRPL15P36523 253 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RIB5P38145 238 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SHE3P38272 425 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W URA8P38627 578 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W WSS1P38838 269 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ATG7P38862 630 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ERV46P39727 415 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YEL025CP39991 1188 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W LSM4P40070 187 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MET28P40573 187 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W LCB2P40970 561 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YGR201CP42936 225 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W FET5P43561 622 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W EMC2P47133 292 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ADO1P47143 340 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W LYS20P48570 428 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PMT5P52867 743 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W DOC1P53068 250 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W AIM14P53109 570 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YGL159WP53110 370 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SWC4P53201 476 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YGR117CP53270 476 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YTP1P53584 459 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W CPR8P53728 308 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W OST6Q03723 332 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ACL4Q03771 387 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YMR155WQ03795 547 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YDR387CQ04162 555 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W CRF1Q04930 467 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YLR283WQ05867 314 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YLR413WQ06689 675 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W IMA2Q08295 589 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RCN2Q12044 265 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data3.26□□□□□ -1.89not detected
VFA1YER128W RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SFM1Q12314 213 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W FRE7Q12333 620 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W POM34Q12445 299 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W VCX1Q99385 411 aa3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
VFA1YER128W POL1P13382 1468 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ERR1P0CX10 437 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ERR2P0CX11 437 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YPK1P12688 680 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W CBS1P14066 229 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W CKA1P15790 372 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W HEM15P16622 393 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PHO81P17442 1178 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SIR1P21691 654 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PRE1P22141 198 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PPH22P23595 377 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YSP3P25036 478 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W BUD5P25300 642 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SEC65P29478 273 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W IMP3P32899 183 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MNS1P32906 549 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YCR087C-AP37263 153 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W APE3P37302 537 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ECM13P38195 257 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W FAT1P38225 669 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ECM8P38246 354 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W TAE1P38340 232 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W DIA4P38705 446 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W BZZ1P38822 633 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W CCT2P39076 527 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RBG1P39729 369 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YER130CP39959 443 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W BUR6P40096 142 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MGS1P40151 587 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YMR147WP40218 223 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RFC4P40339 323 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W FMC1P40491 155 aa3.25□□□□□ -1.89
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