RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636337.1

SPTAN1-231, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-231	ENST00000636337	MYH6	P13533	1939 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	SOBP	A7XYQ1	873 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337		M0QZ92	97 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	ORC4	O43929	436 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	MGEA5	O60502	916 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	FGFR1	P11362	822 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	CCND2	P30279	289 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	NETO1	Q8TDF5	533 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	FOXQ1	Q9C009	403 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	OPLAH	O14841	1288 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	RAB11FIP3	O75154	756 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	LRRN2	O75325	713 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	PROS1	P07225	676 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	SRF	P11831	508 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	MARK3	P27448	753 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	PML	P29590	882 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	PPM1A	P35813	382 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGBP1	P78318	339 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	NEDD9	Q14511	834 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	CABP7	Q86V35	215 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	PJA1	Q8NG27	643 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	GPR152	Q8TDT2	470 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF558	Q96NG5	402 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPG21	Q9NZD8	308 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	DENND3	A2RUS2	1198 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	LAMTOR5	O43504	91 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	SHC2	P98077	582 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPEM2	Q0P670	501 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	LETM2	Q2VYF4	491 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	GPR149	Q86SP6	731 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	ADAM2	Q99965	735 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	PATJ	Q8NI35	1801 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGF2R	P11717	2491 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	FOXP2	O15409	715 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	CXCL14	O95715	111 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	GHRHR	Q02643	423 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	GLG1	Q92896	1179 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	RGS18	Q9NS28	235 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SPTAN1-231	ENST00000636337		C9IYK1	514 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SPTAN1-231	ENST00000636337	TBC1D4	O60343	1298 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SPTAN1-231	ENST00000636337	LILRB5	O75023	590 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SPTAN1-231	ENST00000636337	HMMR	O75330	724 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SPTAN1-231	ENST00000636337	FGR	P09769	529 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SPTAN1-231	ENST00000636337	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SPTAN1-231	ENST00000636337	SEMA3F	Q13275	785 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SPTAN1-231	ENST00000636337	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SPTAN1-231	ENST00000636337	PTPN14	Q15678	1187 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SPTAN1-231	ENST00000636337	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.33	□□□□□ -0.6

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