RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 FOXP2O15409 715 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 STRNO43815 780 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 AHCYL1O43865 530 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 ADCY3O60266 1144 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 PDE8BO95263 885 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 ANP32DO95626 131 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 PAX7P23759 505 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 MFAP3P55082 362 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 TRIM60Q495X7 471 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 RSPH3Q86UC2 560 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 CROCC2H7BZ55 1655 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 SYF2O95926 243 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 CFBP00751 764 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 BTDP43251 543 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 CHRNDQ07001 517 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 FAM160B2Q86V87 743 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 LONP2Q86WA8 852 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 PNMA1Q8ND90 353 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 SENP1Q9P0U3 644 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.37□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 TAF5LO75529 589 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 APBA3O96018 575 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 PLS3P13797 630 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 MARK3P27448 753 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 WDR93Q6P2C0 686 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 TTC1Q99614 292 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 AMNQ9BXJ7 453 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF229Q9UJW7 825 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 UBN2Q6ZU65 1347 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 A0A0D9SFI3 127 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 SRGAP2O75044 1071 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 CCNE1P24864 410 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 RAP1GDS1P52306 607 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 SKOR1P84550 965 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 PRPSAP1Q14558 356 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 RESP18Q5W5W9 173 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 KLC3Q6P597 504 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 RNF169Q8NCN4 708 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 DDHD1Q8NEL9 900 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 TNKSO95271 1327 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 RASA4BC9J798 803 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 F8W8V4 182 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 RASA4O43374 803 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 TTLL1O95922 423 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 PGM1P36871 562 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 ADCK5Q3MIX3 580 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 TBK1Q9UHD2 729 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 LGALS16A8MUM7 142 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 TNNI1P19237 187 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 PTPREP23469 700 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 HSPA13P48723 471 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 COPS2P61201 443 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 ABCB5Q2M3G0 1257 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 CYP4F22Q6NT55 531 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 TPH2Q8IWU9 490 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 SPATA4Q8NEY3 305 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 IL17REQ8NFR9 667 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 PLA2R1Q13018 1463 aa7.36□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 GNGT2O14610 69 aa7.35□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 SRGAP2BP0DMP2 458 aa7.35□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 BRAFP15056 766 aa7.35□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 NQO1P15559 274 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 KRT39Q6A163 491 aa7.35□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.35□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 RHOT2Q8IXI1 618 aa7.35□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 VPS54Q9P1Q0 977 aa7.35□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 HESX1Q9UBX0 185 aa7.35□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 MYO3BQ8WXR4 1341 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms