RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 DNM2P50570 870 aa28.2■■■□□ 2.11
CAPNS1-204ENST00000587718 SNAP25P60880 206 aa28.2■■■□□ 2.11
CAPNS1-204ENST00000587718 CNTN2Q02246 1040 aa28.2■■■□□ 2.11
CAPNS1-204ENST00000587718 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
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CAPNS1-204ENST00000587718 RETREG2Q8NC44 543 aa28.2■■■□□ 2.11
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CAPNS1-204ENST00000587718 KCTD17Q8N5Z5 321 aa28.2■■■□□ 2.1
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CAPNS1-204ENST00000587718 PMS1P54277 932 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
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CAPNS1-204ENST00000587718 NKX3-2P78367 333 aa28.12■■■□□ 2.09
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