RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 RPAINQ86UA6 219 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 RSPH3Q86UC2 560 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 PSMD10O75832 226 aa22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM29Q14134 588 aa22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 RIT2Q99578 217 aa22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 H3BNC9 293 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM192Q8IY95 271 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 GPR37L1O60883 481 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 UPP2O95045 317 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNA5P22460 613 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 MARK3P27448 753 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 KRT76Q01546 638 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 GPM6BQ13491 265 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 CUL4AQ13619 759 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 GLG1Q92896 1179 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM50BQ9Y247 325 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 COL4A6Q14031 1691 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 NCK2O43639 380 aa22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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RABGGTA-210ENST00000559586 STAT5BP51692 787 aa22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 PLCB4Q15147 1175 aa22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 BANK1Q8NDB2 785 aa22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 HAS1Q92839 578 aa22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 RB1P06400 928 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 FIBCD1Q8N539 461 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 GAS7O60861 476 aa22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 GJB2P29033 226 aa22.58■■□□□ 1.21
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RABGGTA-210ENST00000559586 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 POTEDQ86YR6 584 aa22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 GJD3Q8N144 294 aa22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 AZI2Q9H6S1 392 aa22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 VAV3Q9UKW4 847 aa22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 CHRNA1P02708 482 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 INSRRP14616 1297 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 GRIK4Q16099 956 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 NEK9Q8TD19 979 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM20AQ96MK3 541 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 DISC1Q9NRI5 854 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 WDR64B1ANS9 1081 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 BACH1O14867 736 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC26A2P50443 739 aa22.56■■□□□ 1.2
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RABGGTA-210ENST00000559586 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF302Q9NR11 478 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 TBX3O15119 743 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 CHMP2AO43633 222 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF862O60290 1169 aa22.55■■□□□ 1.2
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