RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555068.1

AC004825.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC004825.1, Length 586 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004825.1-201ENST00000555068 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
AC004825.1-201ENST00000555068 FOXQ1Q9C009 403 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004825.1-201ENST00000555068 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AC004825.1-201ENST00000555068 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AC004825.1-201ENST00000555068 RAI14Q9P0K7 980 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004825.1-201ENST00000555068 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004825.1-201ENST00000555068 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004825.1-201ENST00000555068 PTPRFP10586 1907 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004825.1-201ENST00000555068 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.65□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 ALPK3Q96L96 1907 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 KBTBD13C9JR72 458 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 CIAO1O76071 339 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 LRIG2O94898 1065 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 HLA-DOAP06340 250 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 FGFR2P21802 821 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 CAP2P40123 477 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 TREML2Q5T2D2 321 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 TEX11Q8IYF3 940 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 GMIPQ9P107 970 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 UTYO14607 1347 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 A0A0C4DFX4 3053 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 FGRP09769 529 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 CDK5R2Q13319 367 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 FAM9BQ8IZU0 186 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 ANKRD44Q8N8A2 993 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 TRIB2Q92519 343 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 DRC1Q96MC2 740 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 APBA2Q99767 749 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 NCOR1O75376 2440 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 GAKO14976 1311 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 DNAJA2O60884 412 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 FOSL2P15408 326 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 PHKA1P46020 1223 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 BACE1P56817 501 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 HERVK_113P62684 666 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 MECOMQ03112 1051 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 ARSHQ5FYA8 562 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 RNF43Q68DV7 783 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 DPP9Q86TI2 863 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 KAZALD1Q96I82 304 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 USP44Q9H0E7 712 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 CABP5Q9NP86 173 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 GJD2Q9UKL4 321 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.62□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 TTC28Q96AY4 2481 aa6.61□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.61□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 GSC2O15499 205 aa6.61□□□□□ -1.35
AC004825.1-201ENST00000555068 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms