RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 COL1A2P08123 1366 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 GRM6O15303 877 aa13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 RB1P06400 928 aa13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 CYP3A7P24462 503 aa13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM266Q2M3C6 531 aa13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 LEXMQ3ZCV2 418 aa13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 TCEAL5Q5H9L2 206 aa13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 BANK1Q8NDB2 785 aa13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 BICD2Q8TD16 824 aa13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 NEK9Q8TD19 979 aa13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 MBOAT7Q96N66 472 aa13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 FTHL17Q9BXU8 183 aa13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 GABBR1Q9UBS5 961 aa13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 PCDHA4Q9UN74 947 aa13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 WDR81Q562E7 1941 aa13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa13.39□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 NLRC5Q86WI3 1866 aa13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 DTNBO60941 627 aa13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 PSMD10O75832 226 aa13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAJB1P25685 340 aa13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 LTBRP36941 435 aa13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 GATMP50440 423 aa13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 NLRP5P59047 1200 aa13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM189BP81408 668 aa13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 Q4G0T1 1027 aa13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC148Q8NFR7 591 aa13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 TBCKQ8TEA7 893 aa13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 CEP89Q96ST8 783 aa13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 RIT2Q99578 217 aa13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa13.38□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 C9IYK1 514 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 PSAPP07602 524 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 SCRN1Q12765 414 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 PAK2Q13177 524 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 DSC3Q14574 896 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 UGCGQ16739 394 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 PTPROQ16827 1216 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 CTC1Q2NKJ3 1217 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 NPAS4Q8IUM7 802 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 DAGLBQ8NCG7 672 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 ADAMTS10Q9H324 1103 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 UNC45AQ9H3U1 944 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 EPHX3Q9H6B9 360 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 DISC1Q9NRI5 854 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 RGS18Q9NS28 235 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 PDRG1Q9NUG6 133 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 PLAGL2Q9UPG8 496 aa13.37□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 GRXCR2A6NFK2 248 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 WDR64B1ANS9 1081 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 M0QZ92 97 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 RPS6KA5O75582 802 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 DEXIO95424 95 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 CTDNEP1O95476 244 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 TDP2O95551 362 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 VTNP04004 478 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNA5P22460 613 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 CTNNB1P35222 781 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 SARSP49591 514 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 STK3Q13188 491 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 KIZQ2M2Z5 673 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM102BQ5T8I3 360 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM228AQ86W67 206 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 BLIDQ8IZY5 108 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 IL27Q8NEV9 243 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 ETNPPLQ8TBG4 499 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 SPPL3Q8TCT6 385 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 PLVAPQ9BX97 442 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 GJB4Q9NTQ9 266 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 TPCN1Q9ULQ1 816 aa13.36□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 MAGEB2O15479 319 aa13.35□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 OATP04181 439 aa13.35□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 ITGB1P05556 798 aa13.35□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 IL9P15248 144 aa13.35□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 CLCN3P51790 818 aa13.35□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CLSTN3-211ENST00000541667 HYAL1Q12794 435 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms