RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536780.6

MIR9-3HG-201, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MIR9-3HG, Length 4,778 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SESTD1Q86VW0 696 aa14.98□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 RHOT2Q8IXI1 618 aa14.98□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 APOL6Q9BWW8 343 aa14.98□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.98□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.98□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 DPYDQ12882 1025 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 TRIM50Q86XT4 487 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 P3H4Q92791 437 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SNX25Q9H3E2 840 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 DENND3A2RUS2 1198 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SPDYE6P0CI01 402 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 DEFB132Q7Z7B7 95 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ZBTB33Q86T24 672 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 PASKQ96RG2 1323 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 FOXN1O15353 648 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 LPXNO60711 386 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 APBA1Q02410 837 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 METTL23Q86XA0 190 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ABI1Q8IZP0 508 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.97□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SLC16A4O15374 487 aa14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 IFNB1P01574 187 aa14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 PTPN21Q16825 1174 aa14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CAP2P40123 477 aa14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ADSSL1Q8N142 457 aa14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SLC25A27O95847 323 aa14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ITIH3Q06033 890 aa14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 KRT71Q3SY84 523 aa14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 GMCL1Q96IK5 515 aa14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.96□□□□□ -0.01
MIR9-3HG-201ENST00000536780 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 NFIAQ12857 509 aa14.96□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 BFSP1Q12934 665 aa14.96□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 XKR3Q5GH77 459 aa14.96□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.96□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.96□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 FAM83AQ86UY5 434 aa14.96□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.96□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CHST13Q8NET6 341 aa14.96□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 PIK3C2AO00443 1686 aa14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 DGAT1O75907 488 aa14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 NR3C2P08235 984 aa14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ADCY8P40145 1251 aa14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 DNAJC24Q6P3W2 148 aa14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ELP3Q9H9T3 547 aa14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 EFNA5P52803 228 aa14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SNAPC2Q13487 334 aa14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SETDB1Q15047 1291 aa14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 PFASO15067 1338 aa14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ATP8B1O43520 1251 aa14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 IQCB1Q15051 598 aa14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 TRIM7Q9C029 511 aa14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.95□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 VAMP7P51809 220 aa14.94□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CYP27A1Q02318 531 aa14.94□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.94□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.94□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.94□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ENC1O14682 589 aa14.94□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 RPA1P27694 616 aa14.94□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 AP3M2P53677 418 aa14.94□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 DDR1Q08345 913 aa14.94□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.94□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.94□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.94□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SCINQ9Y6U3 715 aa14.94□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MIR9-3HG-201ENST00000536780 HIP1RO75146 1068 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms