RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	COL20A1	Q9P218	1284 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	HAS3	O00219	553 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	PPFIA4	O75335	1185 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	GGPS1	O95749	300 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	SNHG28	P0DPA3	235 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	ALX1	Q15699	326 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	FIBCD1	Q8N539	461 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	ESR2	Q92731	530 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	KAT14	Q9H8E8	782 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	PXMP2	Q9NR77	195 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35F4	A4IF30	521 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP9B	O43861	1147 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	IL2RA	P01589	272 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	IRS1	P35568	1242 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	SERINC5	Q86VE9	423 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	IQCA1	Q86XH1	822 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	TOP1MT	Q969P6	601 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	EVI5L	Q96CN4	794 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	IL17RA	Q96F46	866 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX27	Q96L92	541 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	IGFLR1	Q9H665	355 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPRS	Q13332	1948 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPC	Q03188	943 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	NCOA4	Q13772	614 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR44	Q5JSH3	913 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM50	Q86XT4	487 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM227B	Q96M60	508 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	SI	P14410	1827 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BRB1	525 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	STXBP3	O00186	592 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	TREH	O43280	583 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	GNAT1	P11488	350 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	DGKH	Q86XP1	1220 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	APBB2	Q92870	758 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	UCN2	Q96RP3	112 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	AMN	Q9BXJ7	453 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0D9SFI3	127 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF213	O14771	459 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	MBTPS2	O43462	519 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	CAND2	O75155	1236 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	RB1	P06400	928 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFV1	P49821	464 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKS1A	Q92625	1134 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	CD207	Q9UJ71	328 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	GRM6	O15303	877 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	LGALS2	P05162	132 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	VSIG8	P0DPA2	414 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	CCND2	P30279	289 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	BMPR1A	P36894	532 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	GDF10	P55107	478 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	HYAL1	Q12794	435 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4

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