RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493829.5

USP39-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 2

Gene USP39, Length 1,660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-218ENST00000493829 MYMKA6NI61 221 aa21.58■■□□□ 1.05
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USP39-218ENST00000493829 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
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USP39-218ENST00000493829 KAT2BQ92831 832 aa21.58■■□□□ 1.05
USP39-218ENST00000493829 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.58■■□□□ 1.05
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USP39-218ENST00000493829 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.57■■□□□ 1.04
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USP39-218ENST00000493829 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.56■■□□□ 1.04
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USP39-218ENST00000493829 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.56■■□□□ 1.04
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USP39-218ENST00000493829 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.53■■□□□ 1.04
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USP39-218ENST00000493829 HIP1RO75146 1068 aa21.51■■□□□ 1.03
USP39-218ENST00000493829 TBCAO75347 108 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
USP39-218ENST00000493829 SMC2O95347 1197 aa21.51■■□□□ 1.03
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USP39-218ENST00000493829 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.51■■□□□ 1.03
USP39-218ENST00000493829 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.51■■□□□ 1.03
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