RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 FBXO21O94952 628 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 MPIG6BO95866 241 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 MYBL2P10244 700 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ECE1P42892 770 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 LIMS1P48059 325 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ITGA1P56199 1179 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 PDCD1Q15116 288 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 CMIPQ8IY22 773 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 JDP2Q8WYK2 163 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 FERMT2Q96AC1 680 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ACAP3Q96P50 834 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 MYL10Q9BUA6 226 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 AMNQ9BXJ7 453 aa6.53□□□□□ -1.36
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PRPF40A-208ENST00000472760 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 IRAK3Q9Y616 596 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 PRLP01236 227 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 CCND1P24385 295 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 ADCY2Q08462 1091 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 PTPN21Q16825 1174 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 PHF19Q5T6S3 580 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 TTLL6Q8N841 843 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 KYQ8NBH2 561 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 NOX5Q96PH1 765 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 WRNIP1Q96S55 665 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 BTBD2Q9BX70 525 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 CROTQ9UKG9 612 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 SHTN1A0MZ66 631 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 CYP7B1O75881 506 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 MT-CO1P00395 513 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 CFBP00751 764 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 THBS2P35442 1172 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 RGS3P49796 1198 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 NEK2P51955 445 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 ADAM9Q13443 819 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 FAM84AQ96KN4 292 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 TNKSO95271 1327 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 MAFGO15525 162 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 IL18BPO95998 194 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 GLDCP23378 1020 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 EPHB1P54762 984 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 MYBPC3Q14896 1274 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 UGT8Q16880 541 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 INAVAQ3KP66 663 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 CT83Q5H943 113 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 STPG3Q8N7X2 389 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 OR10A5Q9H207 317 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 MKS1Q9NXB0 559 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 PRSS38A1L453 326 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 ENPP1P22413 925 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 GPR3P46089 330 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 BCAR1P56945 870 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 IL13RA1P78552 427 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 MESP2Q0VG99 397 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 CLUL1Q15846 466 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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