RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.03■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 GDF3Q9NR23 364 aa20.03■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.03■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.03■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PRG0 241 aa20.03■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 PRKCIP41743 596 aa20.03■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 JAG1P78504 1218 aa20.03■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.03■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 NFU1Q9UMS0 254 aa20.03■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.02■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 H0YIN7 160 aa20.02■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 ANXA13P27216 316 aa20.02■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 CARSP49589 748 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 MSL1Q68DK7 614 aa20.02■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.02■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 USP38Q8NB14 1042 aa20.02■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 SH3GL2Q99962 352 aa20.02■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.02■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.02■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
SYNE4-204ENST00000465425 ESYT3A0FGR9 886 aa20.02■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 CES2O00748 559 aa20.02■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 AOC3Q16853 763 aa20.02■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.02■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 SRLQ86TD4 932 aa20.02■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.02■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.02■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.02■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 PARVGQ9HBI0 331 aa20.02■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.01■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.01■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 DYDC2Q96IM9 177 aa20.01■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.01■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 TGFB1I1O43294 461 aa20.01■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 SLITRK3O94933 977 aa20.01■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 KIF4AO95239 1232 aa20.01■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 ECE1P42892 770 aa20.01■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 AKT1S1Q96B36 256 aa20.01■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 WDR18Q9BV38 432 aa20.01■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.01■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 SHTN1A0MZ66 631 aa20■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 POLR2MP0CAP2 368 aa20■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 JAM2P57087 298 aa20■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 LMBR1Q8WVP7 490 aa20■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 PBKQ96KB5 322 aa20■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 SIX2Q9NPC8 291 aa20■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 TMOD2Q9NZR1 351 aa20■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 SCN9AQ15858 1988 aa20■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 MYO1CO00159 1063 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 GAS7O60861 476 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 PPFIA4O75335 1185 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 FERP16591 822 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 PPP2R5CQ13362 524 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 SLC15A2Q16348 729 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC174Q6PII3 467 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 HS2ST1Q7LGA3 356 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 TEX2Q8IWB9 1127 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 KLHL7Q8IXQ5 586 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 GOLPH3Q9H4A6 298 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 EHMT1Q9H9B1 1298 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 GOPCQ9HD26 462 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 TMCO5BA8MYB1 307 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 PSMD10O75832 226 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 H2AFZP0C0S5 128 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 STAT1P42224 750 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 CFAP58Q5T655 872 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 STYK1Q6J9G0 422 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 GJB7Q6PEY0 223 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 SLC30A10Q6XR72 485 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 C1orf186Q6ZWK4 172 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 H2AFVQ71UI9 128 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 DNAAF5Q86Y56 855 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 ZIM3Q96PE6 472 aa19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 KIF13BQ9NQT8 1826 aa19.98■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 CEP104O60308 925 aa19.98■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 GFPT2O94808 682 aa19.98■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 PRELPP51888 382 aa19.98■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 UBXN2AP68543 259 aa19.98■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 FAM178BQ8IXR5 827 aa19.98■□□□□ 0.79
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC57Q8N9N7 239 aa19.98■□□□□ 0.79
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